Para comprender mejor el papel de las granjas de pollos de engorde y de cerdos como reservorios y vehículos de diseminación de E. coli (Ec) seleccionamos 15 BLEE-Ec recuperados deambas granjas ubicades en La Rioja (España) para su secuenciación del genoma completo. Todos los Ec-blaSHV-12 pertenecían a la granja de pollos de engorde y blaCTX-M-14 a las granjas de cerdos co-albergando además el gen de resistencia a colistina (mcr-1.1). La localización de los genes blaBLEE se asignó mayoritariamente a IncI1-blaCTX-M-14 e IncHI2-blaSHV-12 aunque en algunas cepasse observó la localización de estos genes en plásmidos de tipo IncF. Además, la presencia de integrones también fue notoria (intI1-dfrA17-aadA5-qacE-sul1 o intI1-estX-psp-aadA2-cmlA1-aadA-qacL-IS440-sul3), lo que, combinado con su localización en plásmidos movilizables y conjugables o transposones puede suponer un importante reto para la salud pública.
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