En las últimas décadas, la biología de la conservación ha evolucionado hacia aproximaciones multidisciplinares integrando distintas ramas científicas, lo que ha permitido adoptar un enfoque más amplio que ha contribuido al éxito de algunos de los casos más paradigmáticos en la conservación de aves amenazadas. El escribano palustre (Emberiza schoeniclus) es un paseriforme palustre que presenta una serie de particularidades dentro del género Emberiza, incluyendo una gran complejidad taxonómica intraespecífica con 19 subespecies reconocidas. Muchas de estas subespecies están en grave peligro de extinción debido al deterioro generalizado de los humedales en todo el mundo y actualmente no se dispone de evidencia científica que permita asistir a su conservación. Este es el caso del escribano palustre iberoriental (Emberiza schoeniclus witherbyi), una subespecie altamente especializada en humedales mediterráneos, de la que el 85% de sus 240 parejas reproductoras en España se encuentran en tres humedales con graves problemas de conservación asociados. El objetivo principal de esta tesis doctoral es generar una base científica sólida, multidisciplinar, práctica y transferible que contribuya a mejorar el estatus de conservación del escribano palustre iberoriental y otras subespecies de ecología similar. Para ello, se llevaron a cabo seis capítulos que abordaban aspectos fundamentales para su preservación desde múltiples perspectivas.
La secuenciación del mitogenoma completo del escribano palustre iberoriental en el Capítulo 1 permitió reconstruir la historia evolutiva del clado en el que se encuentra, y constatar su distintividad ecológica y evolutiva dentro del género Emberiza, dos de los criterios más mencionados en la literatura científica para justificar la conservación de un taxón. En el Capítulo 2 se llevó a cabo un análisis a largo plazo de la tendencia poblacional y selección de hábitat de los paseriformes palustres habitando un humedal con problemas hídricos, concluyendo que las dinámicas poblacionales del escribano palustre y otras especies simpátricas están fuertemente condicionadas por las variaciones en la superficie inundada del humedal debido a su especialización en hábitats dependientes del agua. Posteriormente se discutieron las implicaciones para la conservación de estos resultados para la preservación de las comunidades de paseriformes palustres, destacando la importancia de mantener una superficie inundada mínima que permita el desarrollo de vegetación helofítica y la gestión de los humedales hacia sistemas heterogéneos. Cuando se analizaron los efectos de un incendio sobre la población reproductora del escribano palustre iberoriental en el Capítulo 3, se observó una mayor densidad de territorios de cría y un mayor solapamiento del área de campeo de los machos en las zonas afectadas por el fuego. El incendio tampoco tuvo ningún impacto sobre el tamaño del territorio, que estuvo fuertemente condicionado por el tipo de hábitat, por lo que se sugiere que los fuegos controlados pueden ser una herramienta de conservación útil y rentable para esta subespecie cuando se utilicen bajo ciertas condiciones descritas. En el Capítulo 4 se llevó a cabo un estudio explorando la disponibilidad de hábitats adecuados y la conectividad entre 54 humedales con y sin presencia reproductora en España. Los resultados permitieron identificar humedales prioritarios para futuros esfuerzos de gestión activa, incluyendo las localidades reproductoras remanentes con mayor disponibilidad de hábitat y/o mayor importancia para la conectividad (Las Tablas de Daimiel, el Delta de l`Ebre y S`Albufera), y humedales no reproductores con gran potencial para conectar el sistema si se llevasen a cabo restauraciones poblacionales. El análisis de viabilidad poblacional realizado en el Capítulo 5, predijo que la población española de escribano palustre iberoriental se reducirá a la mitad en los próximos 20 años y quedará relegada a dos humedales, el Delta de l`Ebre y S`Albufera, extinguiéndose por completo en la década de 2070. La simulación de medidas de conservación previamente propuestas reveló que los refuerzos poblacionales a partir de programas de cría en cautividad combinados con acciones in situ, seguidas de reintroducciones en localidades clave para la conectividad metapoblacional, son las medidas que se prevén más eficaces para su conservación. Por último, en el Capítulo 6 se desarrolló nuevo par de cebadores para sexar individuos de escribano, género Emberiza, de difícil sexado. Los nuevos cebadores permitieron un sexado más eficaz que otros marcadores desarrollados previamente, y fueron utilizados para dar soporte a un programa de cría en cautividad del escribano palustre iberoriental y para estimar, por primera vez, la proporción de sexos de sus poblaciones.
Los resultados de esta tesis son integrados en una discusión general en la que se reflexiona sobre la importancia de conservar el escribano palustre iberoriental, se examina el elevado grado de especialización de esta subespecie hacia un tipo de hábitat amenazado, se proporcionan directrices claras para el manejo de los humedales para su conservación, y se discute el potencial de aplicar distintas medidas de conservación ex situ. Finalmente se sugieren futuras líneas de investigación para garantizar la eficacia de las medidas propuestas y complementar la evidencia generada en este trabajo.
Abstract In the last decades, conservation biology has evolved towards multidisciplinary approaches integrating different scientific disciplines, resulting in broader perspectives that have contributed to the success of paradigmatic cases in bird conservation. The Reed Bunting (Emberiza schoeniclus) is a marsh passerine with unique features within the Emberiza genus, including great intraspecific taxonomic complexity with 19 recognised subspecies. Many of these subspecies are seriously threatened by the widespread degradation of wetlands around the world, and there is currently a lack of scientific evidence to assist their conservation. This is the case of the Eastern Iberian Reed Bunting (Emberiza schoeniclus witherbyi), a subspecies highly specialised in Mediterranean wetlands, for which 85% of its 240 breeding pairs in Spain are found in three wetlands with severe associated conservation concerns. The main objective of this PhD thesis is to generate a solid, multidisciplinary, practical and transferable scientific basis to help improve the conservation status of the Eastern Iberian Reed Bunting and other subspecies of similar ecology. To this end, six chapters were completed, addressing fundamental aspects for its preservation from multiple perspectives.
Complete mitogenome sequencing of the Eastern Iberian Reed Bunting, conducted in Chapter 1, allowed to reconstruct its evolutionary history within the Emberiza genus and to state its ecological and evolutionary distinctiveness, two of the most frequently mentioned criteria in the scientific literature to justify the conservation of a taxon. In Chapter 2, a long-term analysis of population trends and habitat selection of marsh passerines inhabiting a water-stressed wetland was undertaken, concluding that the population dynamics of the Reed Bunting and other sympatric species were strongly conditioned by variations in the flooded area of the wetland due to their specialisation in water-dependent habitats. Subsequently, the implications of these results for the conservation of marsh passerine communities were discussed, highlighting the importance of maintaining a minimum flooded area that allows the development of helophytic vegetation and of managing wetlands towards heterogeneous systems. When analysing the effects of a wildfire on a breeding population of the Eastern Iberian Reed Bunting in Chapter 3, a higher density of breeding territories and a greater overlap of male home ranges were observed in fire-affected areas. The wildfire also had no impact on the size of the territory, which was strongly conditioned by habitat type, suggesting that controlled fires can be a useful and cost-effective conservation tool for this subspecies if used under certain described conditions. In Chapter 4, a study was conducted to explore the availability of suitable habitats and connectivity between 54 wetlands with and without breeding occurrence in Spain. The results allowed identifying priority wetlands for future active management efforts, including the remaining breeding sites with the highest habitat availability and/or importance for connectivity (Las Tablas de Daimiel, Delta de l`Ebre and S`Albufera), as well as non-breeding wetlands with great potential to connect the system if population restorations were implemented. The Population Viability Analysis carried out in Chapter 5 predicted that the Spanish population of the Eastern Iberian Reed Bunting will be halved in the next 20 years and relegated to two wetlands: the Ebre Delta and S`Albufera, and will become completely extinct by the 2070s. Simulation of previously proposed conservation measures revealed that population reinforcements from captive breeding programmes combined with in situ actions, followed by reintroductions in key locations for metapopulation connectivity, are the most effective measures expected for their conservation. Finally, in Chapter 6, a new pair of primers was developed for sexing difficult-to-sex bunting Emberiza spp. individuals. These primers allowed a more efficient sexing than other previously developed markers and were used to support a captive breeding programme for the Eastern Iberian Reed Bunting and to estimate, for the first time, the sex ratio of its populations.
Findings from this thesis are integrated into a general discussion that highlights the importance of conserving the Eastern Iberian Reed Bunting, explores the high degree of specialisation of this subspecies towards a threatened habitat type, provides clear guidelines for wetland management to conserve its breeding populations, and examines the potential of applying different ex situ conservation measures. Future lines of research are finally suggested to ensure the efficacy of the proposed measures and to complement the evidence generated in this study.
Resumen En las últimas décadas, la biología de la conservación ha evolucionado hacia aproximaciones multidisciplinares integrando distintas ramas científicas, lo que ha permitido adoptar un enfoque más amplio que ha contribuido al éxito de algunos de los casos más paradigmáticos en la conservación de aves amenazadas. El escribano palustre (Emberiza schoeniclus) es un paseriforme palustre que presenta una serie de particularidades dentro del género Emberiza, incluyendo una gran complejidad taxonómica intraespecífica con 19 subespecies reconocidas. Muchas de estas subespecies están en grave peligro de extinción debido al deterioro generalizado de los humedales en todo el mundo y actualmente no se dispone de evidencia científica que permita asistir a su conservación. Este es el caso del escribano palustre iberoriental (Emberiza schoeniclus witherbyi), una subespecie altamente especializada en humedales mediterráneos, de la que el 85% de sus 240 parejas reproductoras en España se encuentran en tres humedales con graves problemas de conservación asociados. El objetivo principal de esta tesis doctoral es generar una base científica sólida, multidisciplinar, práctica y transferible que contribuya a mejorar el estatus de conservación del escribano palustre iberoriental y otras subespecies de ecología similar. Para ello, se llevaron a cabo seis capítulos que abordaban aspectos fundamentales para su preservación desde múltiples perspectivas.
La secuenciación del mitogenoma completo del escribano palustre iberoriental en el Capítulo 1 permitió reconstruir la historia evolutiva del clado en el que se encuentra, y constatar su distintividad ecológica y evolutiva dentro del género Emberiza, dos de los criterios más mencionados en la literatura científica para justificar la conservación de un taxón. En el Capítulo 2 se llevó a cabo un análisis a largo plazo de la tendencia poblacional y selección de hábitat de los paseriformes palustres habitando un humedal con problemas hídricos, concluyendo que las dinámicas poblacionales del escribano palustre y otras especies simpátricas están fuertemente condicionadas por las variaciones en la superficie inundada del humedal debido a su especialización en hábitats dependientes del agua. Posteriormente se discutieron las implicaciones para la conservación de estos resultados para la preservación de las comunidades de paseriformes palustres, destacando la importancia de mantener una superficie inundada mínima que permita el desarrollo de vegetación helofítica y la gestión de los humedales hacia sistemas heterogéneos. Cuando se analizaron los efectos de un incendio sobre la población reproductora del escribano palustre iberoriental en el Capítulo 3, se observó una mayor densidad de territorios de cría y un mayor solapamiento del área de campeo de los machos en las zonas afectadas por el fuego. El incendio tampoco tuvo ningún impacto sobre el tamaño del territorio, que estuvo fuertemente condicionado por el tipo de hábitat, por lo que se sugiere que los fuegos controlados pueden ser una herramienta de conservación útil y rentable para esta subespecie cuando se utilicen bajo ciertas condiciones descritas. En el Capítulo 4 se llevó a cabo un estudio explorando la disponibilidad de hábitats adecuados y la conectividad entre 54 humedales con y sin presencia reproductora en España. Los resultados permitieron identificar humedales prioritarios para futuros esfuerzos de gestión activa, incluyendo las localidades reproductoras remanentes con mayor disponibilidad de hábitat y/o mayor importancia para la conectividad (Las Tablas de Daimiel, el Delta de l`Ebre y S`Albufera), y humedales no reproductores con gran potencial para conectar el sistema si se llevasen a cabo restauraciones poblacionales. El análisis de viabilidad poblacional realizado en el Capítulo 5, predijo que la población española de escribano palustre iberoriental se reducirá a la mitad en los próximos 20 años y quedará relegada a dos humedales, el Delta de l`Ebre y S`Albufera, extinguiéndose por completo en la década de 2070. La simulación de medidas de conservación previamente propuestas reveló que los refuerzos poblacionales a partir de programas de cría en cautividad combinados con acciones in situ, seguidas de reintroducciones en localidades clave para la conectividad metapoblacional, son las medidas que se prevén más eficaces para su conservación. Por último, en el Capítulo 6 se desarrolló nuevo par de cebadores para sexar individuos de escribano, género Emberiza, de difícil sexado. Los nuevos cebadores permitieron un sexado más eficaz que otros marcadores desarrollados previamente, y fueron utilizados para dar soporte a un programa de cría en cautividad del escribano palustre iberoriental y para estimar, por primera vez, la proporción de sexos de sus poblaciones.
Los resultados de esta tesis son integrados en una discusión general en la que se reflexiona sobre la importancia de conservar el escribano palustre iberoriental, se examina el elevado grado de especialización de esta subespecie hacia un tipo de hábitat amenazado, se proporcionan directrices claras para el manejo de los humedales para su conservación, y se discute el potencial de aplicar distintas medidas de conservación ex situ. Finalmente se sugieren futuras líneas de investigación para garantizar la eficacia de las medidas propuestas y complementar la evidencia generada en este trabajo.
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