Resumen de El polimorfimso estructural de las secuencias d(ga.Tc)n: aislamiento, caracterización e identificacion de proteinas de interacción especifica con la cadena d(tc)n
Las secuencias alternantes del DNA del tipo d(GA.TC)n son secuencias polimorficas de repeticiones homopurina homopirimidina. Este tipo de secuencia es relativamente abundante en genomas de organismos ecucariotas superiores y se localiza en regiones genomicas especialmente relevantes funcionalmente.
De entre las formas polimórficas que adoptan in vitro, destacan las formas tricatenarias, y en especial a pH neutro la del tipo purina.purina.pirimidina[GA(GA.TC)] o *H-DNA, que se forma en presencia de ciertos iones de metales de transicion, como el cinc, el manganeso, el cadmio o el cobalto. Curiosamente además, este tipo de secuencias in vivo se localizan en regiones genomicas que son especialmente sensibles al ataque de reactivos y enzimas especificos de formas no-B-DNA.
Para determinar la existencia de estos confomeros in vivo, nos hemos centrado en la cadena pirimidinica d(TC)n que es el principal elemento desestabilizador del confórmero *H-DNA. Esta y debido a su alta tendencia a hibridar con la cadena complementaria de purinas d(GA)n ypor consiguiente desmontar la estructura tricatenaria,problamente in vivo sea diana para ser unida por proteinas especificas que la estabilice. A estas proteinas las hemos llamado NOGA.
En un extracto nuclear de células Friend de ratón hay cinco actividades principales de union a un oligonucleótido de secuencia d(TC)20. Estas actividades fueron aisladas, caracterizadas e identificadas como NOGA1/hnRNP L, NOGA2/hnRNP K y NOGA3/hnRNP I. Entre las tres tuvieron unas actividades electroforéticamente iguales a las cinco detectadas en el extracto nuclear inicial. De estas tres, la proteina claramente mas desconocida es NOGA1/hnRNP L. Su grado de especificidad por unir secuencias del tipo d(TC)n fue estudiado y demostró su también preferencia de union por secuencias del tipo d(CA)n y d(C)n ademas de por las d(TC)n. Su capacidad para unirse in vivo a secuencias d(GA.TC)n fue analizada mediante el ensay
