Resumen de Prototipo de arquitectura de computación reconfigurable para el algoritmo de BLASTN
Ramiro Andrés Barrios Barrios Valencia, José Alfredo Jaramillo Villegas, Juan David Hincapié Zea
Blast es uno de los programas más utilizados por los investigadores en Bioinformática [1]. Este software es en realidad una recopilación de cinco subprogramas (blastn, blastp, blastx, tblastn y tblastx). Para su ejecución en un proyecto real, requiere de sistemas de cómputo con altas capacidades de procesamiento y memoria. Al reemplazar la función de búsqueda que se ejecutaba en los procesadores, por una que se procese sobre una plataforma de computación reconfigurable, permite liberar al procesador de dicha tarea y puede significar una reducción en tiempos de ejecución, proporcionando gran ayuda a las investigaciones en secuenciación genética.
