El presente estudio analiza los desafíos que plantea la Inteligencia Artificial (IA) en la docencia y la investigación en la Educación Superior (ES), a partir de las percepciones y experiencias de más de 1.000 estudiantes universitarios de Paraguay. Se adoptó un enfoque cualitativo mediante la aplicación de encuestas y entrevistas semiestructuradas. Los resultados muestran que la IA es percibida como una herramienta útil para mejorar el aprendizaje, facilitar el acceso a la información y apoyar los procesos de investigación. Sin embargo, también plantea desafíos relacionados con la integridad académica, el pensamiento crítico, la dependencia tecnológica y el fortalecimiento de las competencias digitales. Asimismo, se identifican preocupaciones éticas vinculadas con la autoría, la originalidad y el uso responsable de estas herramientas, aspectos que inciden en el desarrollo del aprendizaje autónomo. Los hallazgos evidencian la coexistencia de beneficios y riesgos, lo que resalta la necesidad de una integración crítica de la IA en la ES. Se concluye que las instituciones deben fortalecer sus estrategias pedagógicas y políticas institucionales para promover un uso ético, responsable y reflexivo de la IA, concebida como un recurso complementario que potencie, y no sustituya, las capacidades intelectuales y pedagógicas de los estudiantes.
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