En las enfermedades autoinmunes específicas de órgano como la enfermedad de Graves-Basedow (GD), las células epiteliales endocrinas del tejido son las dianas del daño tisular y expresan de manera ectópica moléculas de MHC de clase II (MHC II). Estos complejos MHC II-péptido expresados en las células epiteliales tienen una conformación compacta, y por tanto están asociados a péptidos de manera estable aunque se desconoce la naturaleza de estos ligandos. Se postula que la expresión de MHC II puede intervenir en el mantenimiento i/o regulación de la respuesta autoinmune in situ. Los resultados de este trabajo han permitido hacer una primera caracterización del repertorio de péptidos naturales presentados por moléculas de HLA-DR en tiroides de pacientes afectados por la enfermedad de GD. En total se han identificado 162 péptidos de 7 muestras de tiroides diferentes. Todos los péptidos eran autólogos, de tamaño estándar (entre 8 y 33 aminoácidos) y la mayoría provenían de proteínas exógenas, muchas de ellas de la matriz extracelular y del coloide. Lo más interesante de este trabajo es que se han secuenciado 8 péptidos de uno de los principales autoantígenos definidos en las enfermedades autoinmunes del tiroides, la tiroglobulina. Que hayamos sido capaces de secuenciar estos péptidos indica que estos son abundantes en los tiroides afectados y por tanto esta elevada densidad de ligandos de tiroglobulina podría ser la causa de la activación de células T específicas. Se han realizado también estudios de asignación y ensayos de unión a HLA-DR y de estos resultados se deduce que muchos de los péptidos aislados de los tiroides son de baja afinidad, incluidos los péptidos de tiroglobulina. Para poder hacer este estudio previamente se caracterizaron los motivos de anclaje de dos de las moléculas expresadas en las muestras analizadas DR8 y DR407. Los resultados nos permitieron relacionar la estructura de los motivos de unión de estas moléculas con las de otros alelos y relacionarlos con la susceptibilidad a ciertas enfermedades autoinmunes. La caracterización de los péptidos presentados por moléculas de MHC-II en autoinmunidad aporta información esencial y puede conducir al diseño de nuevas estrategias terapéuticas.
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