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Caracterización genética del ovino de las Islas Baleares

  • Autores: Agueda L. Pons Barro
  • Directores de la Tesis: María Amparo Martínez Martínez (dir. tes.), Vincenzo Landi (codir. tes.)
  • Lectura: En la Universidad de Córdoba (ESP) ( España ) en 2016
  • Idioma: español
  • Tribunal Calificador de la Tesis: Jordi Jordana i Vidal (presid.), Cecilio Barba Capote (secret.), María del Rosario Fresno Baquero (voc.)
  • Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Recursos Naturales y Gestión Sostenible por la Universidad de Córdoba
  • Materias:
  • Enlaces
    • Tesis en acceso abierto en: Helvia
  • Resumen
    • RESUMEN DE LA TESIS DOCTORAL DE D. / Dª AGUEDA LAURA PONS BARRO Título: CARACTERIZACIÓN GENÉTICA DEL OVINO DE LAS ISLAS BALEARES 1. Introducción El Convenio sobre la Diversidad Biológica (CDB) de 1992 supone un punto de inflexión en la conservación de los recursos genéticos animales. El Convenio contiene tres objetivos básicos: la conservación de la diversidad biológica, la utilización sostenible de sus componentes y el reparto justo y equitativo de los beneficios que se deriven de su utilización mediante un uso sostenible de los recursos genéticos. Su desarrollo e implementación ha supuesto un aumento de actividades dirigidas a la aplicación de programas de conservación y mejora en las razas autóctonas ganaderas. En España en cumplimiento de los compromisos adquiridos se establece un Plan Estratégico para la Conservación, Mejora y Fomento de los Recursos Genéticos Animales, en él se marcan las pautas de los programas y se publica el Catálogo Oficial de Razas de Ganado de Español (Real Decreto 2129/2008, 2009).

      El archipiélago balear, por su historia y geografía, es un territorio rico en patrimonio genético. Tiene su máximo exponente en el ovino con cuatro razas oficialmente reconocidas, todas ellas catalogadas en peligro de extinción: Ibicenca, Mallorquina, Menorquina y Roja Mallorquina. En la actualidad estas razas disponen del correspondiente Libro genealógico y de un programa de conservación y mejora, ambos aprobados y reconocidos oficialmente. Dada la situación del peligro de extinción en la que se encuentran, se considera necesario realizar un estudio de caracterización genética de las cuatro razas para mejorar su gestión y optimizar la eficiencia de los programas.

      En el presente trabajo se propone la utilización de técnicas de genética molecular para el estudio de las poblaciones ovinas de Baleares. Los objetivos son la caracterización genética y el análisis de la diversidad y estructura intrapoblacional de estas razas; el análisis de la diversidad interpoblacional entre los ovinos de Baleares y otras razas de diversas procedencias (Europa, América y Africa); además del estudio de la viabilidad e idoneidad de la utilización de la genética molecular en los programas de conservación y mejora. La información obtenida y las conclusiones extraídas facilitaran la gestión de los programas de conservación y mejora de las razas de las Islas Baleares.

      2. Contenido de la investigación Se realiza un muestrea aleatorio de las poblaciones ovinas de Baleares (100 muestras de la población Ibicenca de Ibiza, 24 muestras de la población de Formentera de Ibiza, 66 de Mallorquina, 80 Roja Mallorquina y 49 Menorquina). Los animales muestreados están inscritos en sus correspondientes Libros Genealógicos. Para los estudios de estructura y distancias genéticas se utilizan datos de otras 30 razas de España, Europa, América y África. Los genotipos de estas razas forman parte de la base de datos del Proyecto Biovis (http://biovis.jimdo.com). Se amplifican 26 microsatélites recomendados por la FAO para estudios de biodiversidad ovina (FAO, 2011) mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Los fragmentos obtenidos se separan en un gel de poliacrilamida mediante electroforesis con un secuenciador automático ABI 377XL. Con el programa GENESCAN ANALYSIS v3.1.2 se analizan los datos recogidos del secuenciador, permitiendo calcular los tamaños de los fragmentos obtenidos y mediante el programa GENOTYPER v2.5 se realiza el genotipado. Para evaluar la diversidad genética dentro de cada población se calculan los siguientes parámetros: número de alelos, número efectivo de alelos, riqueza alélica, alelos privados o únicos, frecuencia alélicas, heterocigosis esperada y observada, FIS y prueba de equilibrio de Hardy-Weinberg. Se estudia la variabilidad genética entre las poblaciones de Baleares, entre estas y otras razas españolas y finalmente con el resto de razas incluidas en el estudio. Para ello se determinan los estadísticos F, de realiza un análisis factorial de correspondencia y se calculan las distancias genéticas entre las poblaciones. Además se realiza un análisis de la estructura de la población mediante el programa STRUCTURE y análisis de varianza molecular AMOVA con el paquete ARLEQUIN v.3.5 comparando las poblaciones de Baleares con el resto en base a su distribución geográfica y su filogenia.

      En el conjunto de las poblaciones de Baleares se observa un total de 292 alelos con un número medio de alelos de 7,59 y una riqueza alélica media de 5,83, siendo la población de Ibiza de la raza Ibicenca la que presenta un valor menor de 4,41 y la Menorquina la que presenta el mayor valor 5,5; la media de alelos únicos es de 0,24, siendo las mismas poblaciones anteriores las que presentan el menor y mayor valor con 0,18 y 0,31 respectivamente. Todas las poblaciones presentan marcadores en desequilibrio, pero solo la población de Ibiza de la raza Ibicenca mantiene 10 marcadores en desequilibrio después de la corrección de Bonferroni. La heterocigosis esperada (He) y observada (Ho) varia ente 0,500 y 0,750, la He es algo inferior en la población de Ibiza de la raza Ibicenca y la Ho es similar en las cinco poblaciones, siendo en todos los casos inferior la Ho a la He. En cuanto a la variabilidad genética dentro de la raza, el valor de Fis se desvía significativamente de 0 en todas las poblaciones, presentando el mayor valor la población de Formentera de la raza Ibicenca (0,18) y los valores menores la población de Ibiza de la raza Ibicenca y la Mallorquina con 0,06 y 0,07 respectivamente. Cuando se analizan las distancias y el número de migrantes entre las poblaciones de Baleares la población más distante es la Ibicenca. Las distancias y la diferenciación genética de las poblaciones de Baleares, se observan claramente en el análisis factorial de correspondencia, en el árbol de distancias individuales y en el dendograma de Neighbor-net. Al revisar la estructura de las poblaciones ovinas de Baleares se observa que el primer grupo que se separa es la población de Ibiza de la raza Ibicenca y en K=5 cada población forma un clúster diferente, con una probabilidad de asignación superior al 80%.

      Cuando se analiza la diversidad genética entre las poblaciones de Baleares y otras razas, se observa que las razas Roja Mallorquina, Menorquina y Mallorquina se encuentran más próximas a otras razas españolas que a las poblaciones de las Pitiüsas (Ibiza y Formentera), en el análisis de distancia destaca la distancia que presentan las razas Palmera, probablemente en ambas por el mismo efecto de aislamiento y deriva genética (Martínez et al., 2005). Al analizar la estructura de las 35 poblaciones de Europa, América y Africa, nuevamente la Ibicenca es la población que primero se separa, el resto de poblaciones se van agrupando en base a su distribución geográfica y origen, como sucede con el grupo de españolas o el grupo de razas africanas con otras razas de pelo. En K=24, K óptimo, cada poblaciones de Baleares forma su propio clúster independiente, mientras que en otras razas aún no se ha conseguido detectar estadísticamente su separación, formando agrupamiento con razas próximas. Al realizar el análisis de los efectos de agrupamiento y su contribución a la diferenciación mediante AMOVA se observa que el mayor porcentaje de contribución lo presenta la propia raza.

      3. Conclusiones Las razas de Baleares presentan una diversidad genética aceptable y una significativa diferenciación entre ellas y el resto de razas analizadas. Las dos poblaciones más amenazadas son las de la raza Ibicenca, no solo por su reducido censo y situación social, sino también por su menor diversidad genética, aunque los resultados obtenidos servirán como base para realizar una correcta gestión genética favoreciendo la conservación de ambas poblaciones.

      Los análisis de distancias de las poblaciones confirman una evolución genética común con otras razas ovinas españolas, con una separación evidente de las razas insulares de las continentales. No se detectan signos de cruces entre las razas ovinas españolas Churra, Segureña, Merino Español y las derivadas del Merino, Fleischschaf y Merino Precoz y las razas de Baleares. Al introducir en el estudio razas de Europa derivadas del Merino Español, de África y de América, las razas se agrupan atendiendo a su distribución geográfica Las poblaciones ovinas de Baleares presentan una escasa influencia genética de las otras razas españolas, europeas y africanas incluidas en el presente estudio.

      La utilización de la genética molecular como herramienta de control y orientación de los programas de conservación y mejora, cuyo objetivo es conseguir el mantenimiento de la máxima cantidad de diversidad genética con el mínimo incremento de consanguinidad posible por generación, resulta muy adecuado. La aplicación de la genética molecular para la asignación de individuos, el control genético de la población y la comprobación de la filiación, resulta una herramienta imprescindible en las poblaciones que se encuentran en una situación crítica, en las cuales descartar un individuo tan solo por sus caracteres morfológicos, puede dificultar su conservación. Posibilita la recuperación de aportes genéticos externos de la población no inscrita en el libro, pero que se encuentra en su entorno, sin que afecte significativamente a la pureza de la raza. Además es una herramienta útil para comprobar la raza de origen de ciertos productos, en defensa de las producciones diferenciadas con animales de razas autóctonas.


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