Estudios de genómica funcional (proteómica y transcriptómica) en especies vegetales modelo (Arabidoptosis thaliana) y forestales (Quercus ilex)

• Autores: Sira Echevarría Zomeño
• Directores de la Tesis: Ana M. Maldonado Alconada (dir. tes.), Jesús V. Jorrin Novo (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad de Córdoba (ESP) ( España ) en 2011
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Rafael M. Navarro Cerrillo (presid.), Nieves Abril Díaz (secret.), María del Mar Castellano Moreno (voc.), Ricardo Alía Miranda (voc.), Elena Prats Pérez (voc.)
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Biología vegetal (botánica)
      • Fisiología vegetal
  • Ciencias agrarias
    • Fitopatología
      • Susceptibilidad y resistencia vegetal
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• Resumen

  • La investigación que se plantea en esta tesis doctoral presenta un doble objetivo, metodológico y biológico. En sintonía con las actuales técnicas ómicas las aproximaciones de biología de sistemas, se están llevando a cabo en nuestro grupo estudios de genómica funcional ¿transcriptómica y proteómica¿ para el análisis de la respuesta a estrés, tanto biótico como abiótico, en diferentes sistemas vegetales. Desde un punto de vista metodológico, y como primer paso para su utilización en posteriores estudios de la respuesta a estrés abiótico, se estableció el protocolo de extracción proteica óptimo para hojas de Arabidopsis. El sistema modelo de la interacción planta¿patógeno Arabidopsis thaliana¿Pseudomonas syringae se utilizó posteriormente para estudiar la S¿nitrosilación de proteínas como mecanismo de señalización y defensa en la respuesta de la planta frente al patógeno. En el estudio de la respuesta a estreses abióticos y con el fin de encontrar los mecanismos moleculares activados por la encina (Quercus ilex) en respuesta al déficit hídrico, así como su capacidad para recuperarse tras un periodo sin riego, se utilizó una aproximación de proteómica de expresión diferencial en ensayos de sequía y recuperación tras la misma. Posteriormente se están llevando a cabo estudios de genética de poblaciones a través de marcadores de DNA, así como de transcriptómica con ensayos de sequía y utilizando individuos provenientes de distintas poblaciones. Como primer paso necesario en dichos estudios, se ha realizado una optimización de los protocolos de extracción de ácidos nucleicos, tanto DNA genómico como RNA, para el tejido objeto de nuestros estudios, es decir, hojas de encina.