Anàlisi de quantitative trait loci i de gens candidats relacionats amb la qualitat de la carn i de la canal en una població Landrace
- Autores: Oriol Vidal Fábrega
- Directores de la Tesis: M. Amills (dir. tes.), Armando Sánchez Bonastre (dir. tes.)
- Lectura: En la Universitat Autònoma de Barcelona ( España ) en 2005
- Idioma: catalán
- Tribunal Calificador de la Tesis: Joan Estany Illa (presid.), Olga Francino Martí (secret.), Luis Silió López (voc.), Alejandro Clop Ponte (voc.), Daniel Villalba Mata (voc.)
- Materias:
- Enlaces
- Tesis en acceso abierto en: TDX
- Resumen
Els treballs que inclou aquest compendi shan desenvolupat dins del projecte FEDER 2FD97-0916-C02-02, que té com a objectiu principal confirmar lexistència, en una població comercial Landrace altament seleccionada, de quantitative trait loci (QTL) prèviament descrits en encreuaments de races divergents. Els caràcters analitzats en aquest projecte inclouen tant mesures de la qualitat de la carn com de conformació i de qualitat de la canal.
Mitjançant la segregació de marcadors moleculars tipus microsatèl·lits en un pedigrí de dues generacions duna població Landrace es van analitzar 10 regions dels cromosomes 1, 2, 3, 4, 6, 7, 8, 9, 10 i 13. Els resultats demostren lexistència defectes als cromosomes 2, 6, 7, 8, 9 i 10, tot indicant que QTL descrits prèviament en encreuaments de races divergents són encara presents en les poblacions comercials.
A més a més shan caracteritzat quatre gens candidats (MDH1, ME1, DECR i ACLS1) relacionats amb el metabolisme lipídic. Encara que en tots quatre shan pogut identificar polimorfismes, només en el cas del DECR les dues transversions detectades provoquen canvis aminoacídics. Els polimorfismes identificats en lME1 i el DECR shan fet servir de marcadors en dos estudis dassociació.
En el cas del gen MDH1 hem pogut observar lexistència a lintró 6 duna inserció del tipus L1Ss que genera un polimorfisme. A més a més, hem identificat una seqüència, anomenada MDH1_, que podria correspondre a un pseudogen no processat del gen MDH1.
El gen ACLS1 sha seqüenciat per primer cop en porcí i mitjançant el panell de cèl·lules somàtiques irradiades ImpRH sha pogut dur a terme el mapeig daquest gen al cromosoma 15, lligat al microsatèl·lit SW1989.
The papers included in this compendium have been developed through the project FEDER 2FD97-0916-C02-02, which has as a main objective to confirm the existence of quantitative trait loci (QTL) described in crosses between divergent breeds segregating in a highly selected Landrace population. Traits analyzed in this project include meat quality, conformation and carcass measures.
The segregation of molecular markers microsatellites positioned in ten chromosomal regions (including chromosomes 1, 2, 3, 4, 6, 7, 8, 9, 10 and 13) was analyzed in a two generation pedigree of a Landrace population. Results show effects on chromosomes 2, 6, 7, 8, 9 and 10, indicating that QTL previously described in divergent crosses are still present in commercial populations.
Moreover, four candidate genes related to lipid metabolism (MDH1, ME1, DECR and ACSL1) have been characterized. Although polymorphisms have been identified in the four gene, only in the DECR the two detected transversions cause aminoacidic changes. Polymorphisms identified in ME1 and DECR have been used in two association analysis.
For the MDH1 gene we have observed the existence of a L1Ss insertion in the intron 6. This insertion generates a polymorphism. In addition, we have identified a new sequence, named MDH1_, which might be a non-processed pseudogene of the MDH1.
The ACSL1 gene has been sequenced for first time in pig. This gene has been mapped to the porcine chromosome 15 linked to the microsatellite SW1989, by using the irradiated somatic cell panel ImpRH.
