From Microbiome Assembly to Root Colonization by Plant-Beneficial Bacteria in the Avocado Rhizosphere

• Autores: Blanca Ruiz Muñoz
• Directores de la Tesis: Francisco Manuel Cazorla López (dir. tes.), José A. Gutiérrez Barranquero (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad de Málaga ( España ) en 2026
• Idioma: inglés
• Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Biología Celular y Molecular por la Universidad de Málaga
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  • Tesis en acceso abierto en: RIUMA
• Resumen

  • El microbioma de la rizosfera desempeña un papel esencial en la nutrición, el desarrollo y la resiliencia de las plantas frente a estreses bióticos y abióticos. Esta Tesis Doctoral aborda la intersección entre el ensamblaje de las comunidades microbianas y la colonización bacteriana en la rizosfera del aguacate (Persea americana Mill.), un cultivo leñoso perenne de gran relevancia en Andalucía, sometido a una creciente limitación hídrica y a una elevada presión fitosanitaria.

    El primer capítulo analiza cómo el manejo agrícola a largo plazo estructura la microbiota de la rizosfera del aguacate bajo sequía recurrente. La comparación de fincas comerciales orgánicas y convencionales reveló que el manejo orgánico deja una huella edáfica y microbiológica diferenciada, favoreciendo la abundancia de bacterias esporuladas. A partir de esta selección se caracterizaron tres cepas (Bacillus halotolerans B19 y B21 y Bacillus subtilis B26) capaces de atenuar los efectos de la sequía en plántulas de aguacate mediante respuestas específicas de cepa que convergen en el gen bdh, vinculado a la producción de 2,3-butanodiol.

    Los capítulos segundo y tercero se centran en Pseudomonas chlororaphis PCL1606, rizobacteria modelo de control biológico frente a Rosellinia necatrix. Se demuestra que la actividad antifúngica solo se traduce en protección efectiva cuando va acompañada de una colonización radicular eficiente. El sistema Flp/Tad, regulado por el compuesto HPR, resultó determinante para la adhesión y la colonización competitiva. Un rastreo genético no sesgado identificó además los genes mlaA y ppiD, implicados en la homeostasis de la envoltura celular, como determinantes clave de la colonización en hospedadores leñosos y herbáceos.

    Descripción En conjunto, la tesis muestra que la funcionalidad del microbioma depende tanto de los filtros ambientales y de manejo como de una colonización radicular eficiente, respaldando estrategias que combinen la gestión del suelo con inoculantes adaptados al nicho radicular.