Validación de genotipado de cáncer colorrectal metastásico por técnica de nueva generación

• Autores: Maria Iria Gallego Gallego
• Directores de la Tesis: Pilar García Alfonso (dir. tes.), Miguel Martín Giménez (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad Complutense de Madrid ( España ) en 2024
• Idioma: español
• Número de páginas: 171
• Tribunal Calificador de la Tesis: José Luis González Larriba (presid.), Andrés Jesús Muñoz Martín (secret.), David García Teruel (voc.), Francisco Díaz Gutiérrez (voc.), Javier Guillermo Cassinello Espinosa (voc.)
• Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Investigación en Ciencias Médico-Quirúrgicas por la Universidad Complutense de Madrid
• Materias:
  • Ciencias médicas
    • Ciencias clínicas
      • Oncología
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en: Docta Complutense
• Resumen
  • español

    Justificación y objetivos: En las últimas décadas se han identificado varios biomarcadores pronósticos y predictivos que permiten personalizar el uso de agentes biológicos en pacientes con cáncer colorectal metástasico (CCRm). Hoy en día hay múltiples técnicas disponibles para el genotipado de estos pacientes, especialmente para determinar las mutaciones de KRAS. Dado que no hay ningún método gold standard, la evaluación difiere entre regiones o incluso entre hospitales dentro de la misma región. El presente estudio ha sido diseñado para identificar biomarcadores moleculares en pacientes con CCRm utilizando la nueva tecnología Genomica® y compararla con métodos estándar empleados en nuestra práctica clínica habitual. Material y métodos: Se han analizado de manera retrospectiva muestras tumorales de una serie de pacientes con CCRm tratados en el Hospital General Universitario Gregorio Marañón. Se ha utilizado la tecnología Genomica® en todas las muestras. Cobas® y ViennaLab StripAssay® han sido empleadas como tecnología de práctica clínica habitual. La secuenciación Sanger se ha usado en casos discrepantes como gold standard. Se ha realizado un análisis estadístico, teniendo en cuenta las características clinicopatológicas de la muestra incluida, comparando Genomica® con técnicas de práctica clínica usual. Resultados: Las mutaciones de KRAS fueron las más frecuentemente detectadas en casi la mitad de las muestras (51.6% Cobas®, 45.2% ViennaLab®, 36.5% Genomica®). La tecnología Genomica® tiene mayor especificidad que las plataformas de práctica clínica habitual, superior al 90% para todos los biomarcadores analizados, a expensas de una ligera menor sensibilidad (en torno a 75% para RAS, 100% para BRAF y 50% para PI3K). Los niveles de concordancia más altos se han obtenido para mutaciones de BRAF y PI3K con niveles moderados en la mayoría de los casos y solo débiles para NRAS. La supervivencia global (SG) fue significativamente mejor en pacientes KRAS wild type con independencia de la metodología empleada (mSG KRAS mutado con Genomica® 24.2 meses frente a 39.8 meses en pacientes nativos, p 0.022; mSG KRAS mutado con técnicas de práctica clínica usual 33.8 meses frente a 45.5 meses en población nativa, p 0.0044). Los pacientes PI3K mutados analizados por Genomica® tuvieron peor SG (mSG PI3K mutado con Genomica® 23 meses frente a 37.1 meses en pacientes wild type, p 0.017) así como los no cuádruple wild type analizados por Cobas®+ViennaLab StripAssay® (mSG 36.3 meses versus 45.6 meses en pacientes wild type, p=0.0225). En análisis multivariantes el estatus wild type de KRAS se asociaba a mejores datos de SG estadísticamente significativos así como la cirugía de metastasis (HR KRAS wild type Genomica® 0.57, IC 95% 0.36-0.89, p=0.015; HR KRAS wild type por técnicas estándar 0.56, IC 95% 0.37-0.87, p=0.009; HR para cirugía de metástasis 0.39, IC 95% 0.21-0.75, p=0.004). Conclusiones: Este estudio observacional y retrospectivo confirma a Genomica® como un método altamente específico en la determinación molecular del CCRm en población española. Los pacientes KRAS mutados con independencia de la metodología empleada tienen peor SG estadísticamente significativa así como las mutaciones de PI3K analizadas por Genomica® y el cuádruple mutado determinado por técnicas de práctica clínica habitual

  • English

    In the last decades, clinicians have identified several prognostic and predictive biomarkers that enable a degree of personalization in the use of biological agents employed in metastatic colorectal cancer (mCRC). Nowadays, there are multiple techniques available for genotyping mCRC, especially to determine mutations in KRAS. Since there is not gold standard method, the evaluation differs in each region and even between different hospitals within the same region. The present study was designed to identify molecular biomarkers in patients with mCRC using Genomica® technology and compare it with the standard methods used in our usual clinical practice...