La producción mundial de olivo está sometida a una fuerte presión tanto por la presencia de plagas de insectos como de enfermedades bacterianas, destacando la mosca del olivo (Bactrocera oleae) y la tuberculosis del olivo, causada por Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi (Pss). Las estrategias de control actuales dependen en gran medida del uso de productos químicos, lo que genera preocupaciones sobre la sostenibilidad y el impacto ambiental. Esta tesis explora enfoques biológicos innovadores para mejorar la defensa del olivo, centrándose en endófitos beneficiosos y en activadores de las defensas vegetales. En primer lugar, ensayos en olfactómetro combinados con el análisis del perfil volátil revelaron que la inoculación con endófitos como Alcaligenes faecalis, Aureobasidium pullulans y Bacillus amyloliquefaciens indujo la emisión de compuestos orgánicos volátiles (COVs) repelentes, que disuadieron significativamente a B. oleae. Paralelamente, la aplicación exógena del péptido vegetal sistemina redujo la oviposición de la mosca y la infestación de frutos, al tiempo que estimuló la emisión de COVs protectores, lo que sugiere su papel en la comunicación defensiva entre plantas. En relación con la tuberculosis, los análisis transcriptómicos (RNA-seq) y metabolómicos no dirigidos (LC-Q-TOF-MS/MS) demostraron que B. amyloliquefaciens estimula las defensas del huésped sin efectos adversos, induciendo una activación temprana de genes y metabolitos relacionados con la defensa. Las plantas coinoculadas mostraron una mayor reprogramación transcripcional y metabólica, incluyendo rutas relacionadas con la regulación redox, el refuerzo de la pared celular, el metabolismo secundario y la reorganización del citoesqueleto, lo que resultó en una menor incidencia y severidad de la enfermedad. En conjunto, estos hallazgos ponen de relieve el potencial de los endófitos y de los péptidos inductores de defensa como estrategias sostenibles para la protección del olivo, aportando nuevas perspectivas sobre las bases moleculares y metabólicas de la resistencia vegetal frente a plagas y patógenos clave. Además de los estudios experimentales, la tesis ofrece una visión integradora de la biología del olivo, el estado de sus principales plagas y enfermedades, el papel ecológico y protector de los endófitos, y la aplicación de herramientas ómicas más apropiadas para desentrañar las interacciones planta–microorganismo.
Global olive production is under severe pressure from both insect pests and bacterial diseases, most notably the olive fruit fly (Bactrocera oleae) and olive knot, caused by Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi (Pss). Current management strategies rely heavily on chemical control, raising concerns about sustainability and environmental impact. This thesis explores innovative approaches to enhance olive defence, focusing on beneficial endophytes and plant defence activators. First, olfactometer assays combined with volatile profiling revealed that inoculation of olive trees with the endophytes Alcaligenes faecalis, Aureobasidium pullulans, and Bacillus amyloliquefaciens induced the emission of repellent volatile organic compounds (VOCs), significantly deterring B. oleae. In parallel, exogenous application of the peptide systemin in olive branches reduced olive fly oviposition and fruit infestation bypriming the emission of protective VOCs, with effects extending to neighboring untreated branches, suggesting plant-to-plant defence signaling. In relation to olive knot,, transcriptomic (RNA-seq) and non-targeted metabolomic (LC-Q-TOF-MS/MS) analyses demonstrated that B. amyloliquefaciens primes host defences without deleterious effects, inducing early activation of defence-related genes and metabolites. Co-inoculated plants exhibited enhanced transcriptional and metabolic reprogramming, including pathways related to redox regulation, cell wall reinforcement, secondary metabolism, and cytoskeletal reorganization, resulting in reduced disease incidence and severity. Collectively, these findings highlight the potential of endophytes and defence-inducing peptides as sustainable strategies for olive protection, offering novel insights into the molecular and metabolic bases of plant resistance against major pests and pathogens. In addition to the experimental studies, the thesis provides an integrative overview of olive tree biology, the status of its main pests and diseases, the ecological and protective roles of endophytes, and the application of more appropriate omics tools to unravel plant–microbe interactions.
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