Análisis de la transcripción de línea germinal (TLG) del locus IGH en respuesta a la vacunación y su relación con la movilización de plasmablastos y la memoria inmunológica

• Autores: Helena Kuri Magaña
• Directores de la Tesis: Jesús Martínez Barnetche (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad Nacional Autónoma de México ( México ) en 2020
• Idioma: español
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en: ru.dgb.unam.mx
• Resumen
  • español

    La recombinación de cambio de clase (RCC) en células B es un proceso que modifica la función efectora de los anticuerpos a través dela recombinación de ADN de la región constante de IgM por otro isotipo (IgG, IgA o IgE), para responder de la mejor manera ante un tipo de antígeno específico. La RCC depende de la transcripción no codificante (RCCnc) de exones IHlocalizados 5' río arribade cada gen codificante CH. Desconocemos la importancia de la transcripción RCCnc en humanos sanos y en respuestas inmunológicas aberrantes.Para caracterizar la transcripción RCCncen una gran variedad de condiciones de salud y enfermedad,mapeamos la transcripción deexones IHhumanos mediante el análisis de 70,603 muestras de RNA-seqpúblicamente disponibles, utilizandola herramienta informáticarecount2. Validamos la expresión de I, Ie Ien sangre periférica de voluntariossanosvacunados con Hepatitis B, Tétanos/Difteria, e influenza mediante qPCR.Caracterizamos,mediante minería de datos,la transcripción RCCnc en tejidos sanos y neoplásicos, así como en enfermedades infecciosas e inflamatorias.Identificamos la transcripción de 10 IHen el locus IGHhumano(chr14q32.33).La transcripción RCCnc está ampliamente distribuida en tejidos humanos sanos y depende de la abundancia de tejido linfoide secundario asociado. En la etapa fetal, Ies expresado de manera única en diferentes tejidos linfoides y no linfoides, sugiriendo un papel diferente a la RCC. La transcripción IHen neoplasias tiende a la disminución con respecto a tejido sano, a excepción de cáncer mamario, pancreático, y testicular, sugiriendo cambios en el microambiente tumoral e inmunoedición. Finalmente, identificamos “firma” transcripcional de Iand Ien enfermedad de Crohn, relacionada únicamente con ulceración profunda, sugiriendo un microambiente inflamatorio particular que promueve RCC a IgD+.Nuestro análisis indica quea transcripción RCCnc es amplia y refleja el microambiente inmunológico en condiciones normales y su modificación como resultado del proceso patológico. Estos perfiles pueden servir como marcadores de la respuesta de células B en respuestas inmunes normales (vacunación) y en diversas patologías.

  • English

    Class switch recombination (CSR) in B cells is a process that modifies the effector function of antibodies through DNA recombination of the constant region of IgMto another isotype (IgG, IgA or IgE) to betterrespondto a specific type of antigen.CSRdepends on non-coding transcription (CSRnc) of IHexons located 5 'upstream of each CHcoding gene. We ignorethe importance of CSRnc transcription in healthy humans and in aberrant immune responses.To obtain deeper insight of CSRnc transcription in humans, we mappedhuman IHexons by analyzing 70,603 RNA-seq publicly available samples, using the recount2software. We validatedthe expression of I, Iand Iin peripheral blood of volunteers vaccinated with Hepatitis B, Tetanus/Diphtheria, and influenza by qPCR, andcharacterized, through data mining, CSRnc transcription in healthy and neoplastic tissues, as well as in infectious and inflammatory diseases.Our approach allowed the identification of 10 IHexons in the human IGHlocus(chr 14q32.33). CSRnc transcription is widely distributed in healthy human tissues and depends on the abundance of associated secondary lymphoid tissue. In fetal stage, Iis expressed uniquely in different lymphoid and non-lymphoid tissues, suggesting a different role than CSR. IHtranscription in neoplasms tends to decrease with respect to healthy tissue, with the exception of breast, pancreas, and testicular cancer, suggesting changes in the tumor microenvironment. Finally, we identifieda transcriptional “footprint” of Iand Iin Crohn's disease, related exclusivelyto deep ulceration, suggesting a particular inflammatory microenvironment that promotes CSRto IgD+.Our data indicates that CSRnc transcription is broadly distributed in human tissuesand reflects the immune microenvironment in normal conditions and its modification as a result of the pathological process. These profiles can serve as markers forB cell response in normal immune responses (vaccination) and in various pathologies.