Eficiencia de la Técnica de Array de ADN genómico en el diagnóstico molecular de los trastornos del neurodesarrollo
- Autores: Irene Ferrer Bolufer
- Directores de la Tesis: Antonio Ferrández Izquierdo (dir. tes.), Raquel Rodríguez López (codir. tes.)
- Lectura: En la Universitat de València ( España ) en 2024
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Carmen Orellana Alonso (presid.), Juan Silvestre Oltra Soler (secret.), Francisco Barros Angueira (voc.)
- Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Medicina por la Universitat de València (Estudi General)
- Materias:
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- Resumen
Cambios en el genoma como deleciones, duplicaciones, inserciones, translocaciones, inversiones, polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) o variaciones en número de copias (CNVs) son responsables de la diversidad genética de la especie humana. Una CNV es un segmento de ADN cuyo número de copias es variable comparándolo con un genoma de referencia. Se estima que en cada genoma individual, las CNVs representan un 1.2% de diferencias en relación al genoma humano de referencia, por ello, suponen una importante contribución a la diversidad genética pero también ha sido probada su implicación en un gran número de enfermedades. La clasificación de las CNVs como polimorfismos no responsables de un efecto patogénico o como factores de susceptibilidad a enfermedad, es un reto. Para facilitar la interpretación de estos cambios la American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) y Clinical Genome Resource (ClinGen) publicaron un consenso basado en un sistema de puntuación semicuantitativo que permite escalar y comparar la posible funcionalidad de las variantes.
El array de genoma completo es una técnica utilizada en diagnóstico genético, que nos permite analizar el genoma completo de un individuo en busca de alteraciones de ganancia o pérdida de material genético (CNVs). Debido a su especificidad y sensibilidad, esta técnica está considerada según consensos nacionales e internacionales, como prueba diagnóstica de primera elección en pacientes con fenotipos de retraso global del desarrollo/discapacidad intelectual, trastornos del espectro autista y anomalías congénitas múltiples. Siguiendo las indicaciones de dichos consensos, tras haber realizado previamente estudios citogenéticos y/o moleculares dirigidos a fenotipos reconocibles en aquellos casos en los que estuvieran indicados, recopilamos la información analítica y clínica de 350 pacientes que se mantenían sin diagnóstico. Estos pacientes fueron analizados mediante array de genoma completo de SNPs/CNVs de alta densidad (CytoScan HD) por padecer fenotipos sindrómicos con discapacidad intelectual no filiada asociada a rasgos dismórficos y/o malformaciones congénitas. Nuestra serie está compuesta principalmente por pacientes pediátricos y algunos adultos, con ancestro poblacional mayoritariamente valenciano. La descripción fenotípica de toda la serie se realizó de forma exhaustiva y según nomenclatura de Human Phenotype Ontology (https://hpo.jax.org/app/). Se detectó en 33 de ellos (9,43%) una alteración genética patogénica o probablemente patogénica. Se confirmó, por tanto, la eficiencia de la técnica de array de ADN genómico como herramienta de primera línea en el diagnóstico molecular de los TND no filiados.
No hay dudas de que la implementación continua de nuevas tecnologías ampliará los tipos de CNVs que se encuentran en el entorno clínico, así como nuestra comprensión de su impacto en la salud humana.
