La autofluorescencia es un fenomeno de emision microscopica expontanea y puede inducir a error en la fluorocromia. Se han estudiado materiales animales y vegetales por procedimientos histologicos clasicos (extendidos, cortes de congelacion, parafina y epoxiresinas) utilizandose microscopia de epifluorescencia y espectrofluorimetria. El fenomeno es dependiente del tiempo y tipo de fijador, medio de inclusion, espesor de corte, longitud de onda de excitacion y filtros de barrera microscopicos empleados. Las estructuras autofluorescentes son generalmente aquellas que tienen un gran contenido proteico y su emision aumenta con los fijadores aldehidicos y su tiempo de fijacion, asi como en secciones cuyo espesor es grande. Hay estructuras autofluorescentes o no dependiendo del fijador y del procesamiento histologico. En el fenomeno se implican dispersiones del haz de excitacion de lo cual son responsables los filtros microscopicos de barrera. Una estructura posee autofluorescencia mas real cuando su emision esta mas alejada de la excitacion y es mas insensible a esta ultima. Para caracterizar la autofluorescencia y sus componentes es necesario hacer un analisis microespectrofluorimetrico, si se carece de estos medios es aconsejable realizar controles antes de la reaccion de fluorocromia, asi como utilizar para la excitacion longitudes de onda en las cuales la autofluorescencia sea menor y que mantengan el color de emision de la fluorescencia inducida.
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