La aplicación de técnicas de ecología molecular al estudio del río Tinto nos ha permitido conocer el nivel de diversidad procariota del mismo y avanzar un modelo de su funcionamiento.
La coexistencia en el sistema de zonas óxicas y anóxicas permite desarrollar estudios sobre la influencia de las mismas en la microbiología del hierro y su implicación no solo en el funcionamiento del sistema sino también en la historia geomicrobiolgica de la tierra y en otros sistemas planetarios.
En la caracterización de las dos zonas aerobia y anaerobia del río Tinto se ha considerado de gran interés profundizar en el conocimiento del papel de Acidiothiobacillus ferrooxidans capaz de oxidar el hierro en presencia de oxígeno y reducirlo utilizando azufre elemental como fuente de energía en condiciones anaerobias, con el fin de comprender su papel en el funcionamiento del sistema y refinar el modelo de funciones generales del mismo.
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