Se lleva a cabo una estimación de la filogenia de Thymelaea y de su relación con otros géneros próximos mediante el análisis de caracteres morfológicos y de la secuencia de la región ITS del ADNr.
Los caracteres moleculares ponen de manifiesto la cladogénesis rápida o simultánea sufrida por el género tras su diferenciación como entidad independiente dentro de la familia.
La aproximación de una escala temporal para la filogenia lleva a proponer como hipótesis más favorable que la radicación de Thymelaea ocurrió en el Mioceno superior en territorio iberomauritano y que el origen del género se sitúa en el entorno del Mediterráneo y se remonta al Mioceno medio.
Ambos sucesos evolutivos se asocian al incremento de la aridez climática en la cuenca mediterránea y a los cambios fisiográficos y paleogeográficos ocurridos entonces.
La expansión del grupo taronraira-velutina fue posterior al Messiniense.
En este grupo se ha detectado una importante desproporción entre la tasa evolutiva asociada a los caracteres morfológicos y la asociada a los caracteres moleculares.
Se descubren sucesos de hibridación introgresiva entre T.granatensis, T.pubescens y T.sanamunda.
La monofilia de Thymelaea es respaldada en todas las reconstrucciones filogenéticas llevadas a cabo. Daphne se revela grupo hermano de Thymelaea. Diarthron, tal y como fue redefinido por Tan (1982), resulta polifilético, apoyándose la recuperación del estatus genérico para Stelleropsis y Dendrostellera.
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