Identificación de nuevas formas recombinantes del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 mediante análisis de secuencias completas del genoma vírico

• Autores: Michael M. Thomson Okatsu
• Directores de la Tesis: Rafael Nájera Morrondo (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad Autónoma de Madrid ( España ) en 2002
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Esteban Domingo Solans (presid.), José María Peña Sánchez de Rivera (secret.), C. López Galíndez (voc.), Maria Angeles Muñoz Fernandez (voc.), Joaquín Dopazo Blázquez (voc.)
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• Resumen

  • Se describen dos nuevas formas recombinantes circulantes (CRFs) del Virus de la Inmunodeficiencia Humana tipo 1 (VIH-1), la CRF12-BF y la CRF14-BG, identificadas, respectivamente, en Argentina y Galicia, analizadas mediante amplificación del genoma completo.

    Además de las formas circulantes se analizan los genomas completos de recombinantes únicos relacionados con dichas CRFs y, en Galicia, de virus de subtipo G no recombinantes.

    En Argentina, se describe por primera vez una alta prevalencia de recombinantes BF. Se analizaron secuencias completas de 8 virus recombinantes, directamente amplificadas de ADN proviral de células mononucleares de sangre periférica.

    Se observaron 6 ptrones de recombinación diferente. Dos puntos de recombinación eran idénticos en los 8 virus y otros 7 puntos de recombinación consenso, y sólo esos 9, estaban presentes en dos virus, que representan una nueva forma recombinante circulante (CRF12-BF). Los árboles filogenéticos y los análisis de aminoácidos y nucleótidos característicos apoyan el origen común de los recombinantes BF de Argentina y la relación filogenética de los segmentos de subtipo F con virus de subtipo F de Brasil. Las distancias genéticas y las fechas de infección sugieren que la CRF12-BF es la más antigua de las CRFs de VIH-1 de origen no africano. En vista de la no detección de virus de subtipo F no recombinantes en Argentina, se emite la hipótesis de un posible origen brasileño de la CRF12-BF.

    En Galicia, se describe la circulación de cepas de VIH-1 recombinantes BG y de subtipo G no recombinante en una minoría de usuarios de drogas inyectables. Se analizan secuencias del genoma completo de 9 virus, 7 recombinantes BG y 2 subtipo G no recombinante, amplificadas directamente de ARN del plasma. Seis de los recombinantes BG presentan una estructura en mosaico idéntica, con dos únicos puntos de recombinación que delimitan un segmento de subtipo B que comprende la