Identificación taxonómica y molecular de Thysanoptera en aguacate en el Valle del Cauca
- Autores: Martha Yazmin Sanchez Roncancio
- Directores de la Tesis: Jaime Eduardo Muñoz Flórez (dir. tes.), Roberto Johansen-Naime (dir. tes.)
- Lectura: En la Universidad Nacional de Colombia (UNAL) ( Colombia ) en 2024
- Idioma: español
- Títulos paralelos:
- Taxonomic and molecular identification of Thysanoptera in avocado in the Cauca Valley
- Materias:
- Enlaces
- Tesis en acceso abierto en: repositorio.unal.edu.co
- Resumen
- español
La presente investigación se desarrolló en 15 Municipios del departamento del Valle del Cauca y un municipio del departamento del Cauca, el muestreo consistió en ubicar 10 árboles de aguacate por finca y colectar los trips de los cuatro puntos cardinales de cada árbol, el total obtenido fue de 210 trips, a los cuales se les realizó identificación morfológica y molecular con los marcadores COI e ITS2. Para la identificación morfológica se montaron 206 trips en bálsamo de Canadá después de pasar por proceso de aclaramiento y secado y mediante las claves dicotómicas de Mound y Marullo (1996) fueron identificados.
Paralelamente se realizó la extracción de ADN con el Kit de Quiagen para tejidos y se amplificaron 174 secuencias, de las cuales 142 amplificaron con el marcador ITS2, 135 con el marcador COI y 104 amplificaron la misma secuencia con los dos marcadores. El tamaño de los productos de PCR obtenidos para ITS2 fue de 406 pares de bases (pb) y para COI de 575 (pb). Finalmente se determinaron morfológicamente las especies de Frankliniella gardeniae Moulton, 1948, Scirtothrips astrictus Mound y Marullo, 1996 Mesothrips sp., Frankliniella sp cf gardeniae, y hay evidencia de especies nuevas de Frankliniella. El análisis AMOVA con los dos marcadores reveló que hubo variación genética entre poblaciones (54%; P= 0,0) y dentro de poblaciones (45%; P=0,0). Las comparaciones pareadas mostraron alta diferenciación poblacional de las secuencias de Buenaventura y La Unión con el resto de secuencias, los valores de distancia interespecífica fueron mayores a la variación intraespecífica y se plantea la posibilidad de que las secuencias identificadas como Frankliniella gardeniae sean en realidad un complejo de especies cripticas. (Texto tomado de la fuente)
- English
The present research was carried out in 15 municipalities of the Valle del Cauca department and one municipality of the Cauca department. The sampling consisted of locating 10 avocado trees per farm and collecting thrips from the four cardinal points of each tree. A total of 210 thrips were collected, which were morphologically and molecularly identified using COI and ITS2 markers. For morphological identification, 206 thrips were mounted in Canada balsam after undergoing clearing and drying processes, and were identified using Mound y Marullo's (1996) dichotomous keys. DNA was extracted using the Quiagen tissue kit, and 174 sequences were amplified, with 142 amplifying with the ITS2 marker, 135 with the COI marker, and 104 amplifying the same sequence with both markers. The size of the PCR products obtained for each gene was 406 base pairs (bp) for ITS2 and 575 bp for COI. Finally, the species Frankliniella gardeniae (Moulton, 1948), Scirtothrips astrictus (Mound y Marullo, 1996), Mesothrips sp., Frankliniella sp cf gardeniae were identified morphologically, and there was evidence of new species of Frankliniella.
The AMOVA analysis with the two markers revealed genetic variation among populations (54%; P = 0.0) and within populations (45%; P = 0.0). Paired comparisons showed high population differentiation of sequences from Buenaventura and La Union with the rest of the sequences. The values of interspecific distance were higher than the intra-specific variation, suggesting the possibility that the sequences identified as Frankliniella gardeniae may actually be a complex of cryptic species.
- español
