Análisis estructural del polimorfismo cuaternario en las helicasas replicativas y del complejo DnaB-DnaC de Escherichia coli
- Autores: Montserrat Bárcena Martín
- Directores de la Tesis: José María Carazo García (dir. tes.)
- Lectura: En la Universidad Autónoma de Madrid ( España ) en 2000
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Francisco Montero Carnerero (presid.), José Berenguer Carlos (secret.), Michael Radermacher (voc.), Juan Carlos Alonso Navarro (voc.), Luis Menéndez Arias (voc.)
- Calificación: Sobresaliente Cum Laude
- Materias:
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- Resumen
Se han utilizado técnicas de microscopía electrónica y procesamiento de imagen para caracterizar tres helicasas hexaméricas: G40P de SPP1, RepA de RSF1010 y DnaB de Escherichia Coli. Las tres enzimas son proteínas hexaméricas que se ensamblan en estructuras con un canal central y forma de anillo.
Se ha desarrollado una nueva aplicación del algoritmo del mapa auto-organizativo que permite detectar diferencias en la simetría de las imágenes de microscopía electrónica. Los resultados obtenidos evidencian la existencia de un polimorfismo estructural para las tres helicasas, con coexistencia de formas cuaternarias de simetria C3 y C6. Se ha delimitado el pH como el factor que controla este polimorfismo estructural in vitro. Sin embargo, el complejo formado entre DnaB y DnaC adopta una arquitectura C3, con independencia del valor del pH. La proteína auxiliar DnaC congela a la helicasa DnaB en una arquitectura de simetria rotacional de orden 3. La reconstrucción tridimensional de DnaB. DnaC a 27 A de resolución, muestra que tanto DnaB como DnaC forman dos trímeros de dímeros asimétricos que se disponen uno sobre otro y girados entre sí. El canal central de la helicasa DnaB resulta parcialmente ocluido en el complejo, lo que podría dar cuenta de su inactivación en el complejo.
