El regulador transcripcional Xy1R de Pseudomonas putida respuesta a inductores aromáticos y aplicaciones biotecnológicas
- Autores: Junkal Garmendia
- Directores de la Tesis: Víctor de Lorenzo Prieto (dir. tes.)
- Lectura: En la Universidad Autónoma de Madrid ( España ) en 2001
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Salas Margarita (presid.), Remacha Miguel (secret.), Moriyon Ignacio (voc.), Bertoni Giovanni (voc.), Fernando Rojo (voc.)
- Materias:
- Texto completo no disponible (Saber más ...)
- Resumen
Las cepas de Pseudomonas putida que portan el plásmido TOL pWWO pueden vivir utilizando tolueno como única fuente de carbono y energia debido a la expresión de dos operones catabólicos. El operón superior se expresa a partir del promotor Pu, dependiente del factor s-54. Este promotor es activado a distancia por un regulador transcripcional que responde a sustratos de la ruta, denominado Xy1R. En ausencia de estos compuestos Xy1R se sintetiza constitutivamente en una forma inactva. En presencia de sustratos, el regulador sufre un cambio conformacional convirtiéndose en una proteina activa para promover la transcripción en Pu. Esta proteína perteneciente a la familia de activadores NtrC, presenta una organización modular en cuatro dominios.
La región C-terminal (dominio D) está implicada en la unión al promotor.
El dominio central tiene capacidad de unión e hidrólisis de ATP y de oligomerización.
Los dominios restantes (B y A), las regiones menos conservados en cuanto a secuencia en la familia, han sido objeto de estudio en esta Tesis. El dominio B es una región corta, con predicción de estructura secundaria coiled-coil. El estudio de su implicación en el mecanismo de activación de Xy1R en respuesta a inductores ha sido una parte de este trabajo. El dominio A es la región implicada directamente en el reconomiento y unióno del inductor aromático. En esta Tesis se ha estudiado la actividad del dominio A de Xy1R a traves del diseño de un sistema de evolucion dirigida in vitro con el objetivo de construir reguladores transcripcionales a la carta, con nuevas actividades pre-determinadas. Estos activadores nuevos se han empleado en el desarrollo de un sistema de detección de un pesticida (Lindano) in situ.
