Diversidad de patógenos en aves silvestres neotropicales: estrategias de descubrimiento e identificación del papel de las especies hospedadoras

• Autores: Daniel A. Truchado
• Directores de la Tesis: Laura Benítez Rico (dir. tes.), Javier Pérez-Tris (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad Complutense de Madrid ( España ) en 2021
• Idioma: español
• Número de páginas: 152
• Títulos paralelos:
  • Diversity of pathogens in neotropical wild birds: Discovery strategies and identification of host species roles
• Tribunal Calificador de la Tesis: María Isabel Simarro Fernández (presid.), Alvaro Ramírez García (secret.), Martina Ferraguti (voc.), Josué Martínez de la Puente (voc.), César Muñoz Fontela (voc.)
• Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Biología por la Universidad Complutense de Madrid
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Biología animal (zoología)
      • Parasitología animal
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en: Docta Complutense
• Resumen
  • español

    Con esta tesis doctoral se pretende arrojar luz en el campo de los patógenos que circulan en la fauna silvestre, más en concreto, en las aves silvestres. En un contexto global en el que la transmisión de patógenos entre fauna silvestre, animales domésticos y humanos es mayor que nunca, los estudios con aproximaciones enfocadas al descubrimiento de nuevos patógenos en la fauna silvestre son esenciales para la salud humana, la conservación de especies o la ecología. Sin embargo, con algunas excepciones, pocos son los patógenos estudiados en aves silvestres. En nuestra investigación, nos hemos centrado en dos grupos importantes de patógenos que portan este grupo de animales: los virus y los hemosporidios, dos modelos que permiten diferentes perspectivas en el estudio de los patógenos de aves. Además, pretendemos resaltar el valor de las zonas remotas como fuente de nueva información en el ámbito de la diversidad de patógenos y de las aproximaciones enfocadas al descubrimiento como una herramienta esencial para su estudio. Para ello, muestreamos la comunidad de aves silvestres del sotobosque en un bosque tropical húmedo de la Reserva Natural de Nouragues (Guayana Francesa) y analizamos su viroma cloacal mediante secuenciación profunda y la comunidad de hemosporidios que los infectan utilizando las últimas técnicas de cribado molecular disponibles.

    Demostramos que, si miramos en hospedadores y regiones del planeta poco explorados, encontramos una nueva diversidad de patógenos y de relaciones con sus hospedadores. Estos resultados cambian el paradigma imperante sobre la distribución de patógenos entre los hospedadores tanto en el tiempo actual (los paseriformes pueden ser considerados hospedadores importantes de ciertos virus y parásitos) y en el tiempo evolutivo (el espectro filogenético y la diversidad de estructuras genómicas se hacen más amplios para los virus). El uso de nuevas técnicas mostró que la prevalencia de parásitos pudiera ser más alta de lo pensado, aunque estas técnicas no están exentas de problemas asociados. Además, mostramos cómo la malaria aviar afecta de forma desigual a los paseriformes de Nouragues, habiendo unas especies que concentran la mayoría de infecciones y otras que parecen evitar la infección.

    Con ello, ponemos de manifiesto la importancia de muestrear en hospedadores poco estudiados que habitan en zonas remotas como requisito indispensable para ampliar de forma sustancial el conocimiento disponible acerca de la diversidad de patógenos de las aves.

  • English

    With this PhD thesis, we want to shed some light on the field of pathogens circulating in wildlife, more specifically, in wild birds. In a global context where pathogen transmission among wildlife, domestic animals and humans is higher than ever before, studies following a discovery-driven approach are essential for human health and biodiversity conservation. However, with some exceptions, few pathogens have been studied in wild birds. In our research, we have focused on two important groups of pathogens carried by this group of animals: viruses and haemosporidians, two models that allow different perspectives in the study of avian pathogens, from discovery to ecological function. Furthermore, we want to highlight the value of remote regions as sources of novel information about pathogen diversity and discovery-driven approaches as essential tools for their study. To this end, we sampled the understory community of wild birds in a tropical rainforest of the Nouragues Natural Reserve (French Guiana) and we analyzed its cloacal virome and the community of haemosporidians infecting them.

    The general objective of this PhD thesis is to highlight how discovery-driven research on pathogens of wildlife living in remote regions contributes substantially to expand the knowledge in the fields of virology and parasitology. With this information, we will improve the understanding of the diversity, host range, ecology and prevalence of both cloacal viruses and haemosporidians infecting birds from Nouragues. Therefore, the four main objectives of this thesis can be summarized in biodiscovery, screening of pathogens in Guianan birds, highlight remote regions and non-traditional hosts as sources of relevant new information in viral discovery and the analysis of avian malaria parasites in Nouragues...