“the clever machine” – a computational tool for dataset exploration and prediction

• Autores: Petr Klus
• Directores de la Tesis: Gian Tartaglia (dir. tes.)
• Lectura: En la Universitat Pompeu Fabra ( España ) en 2016
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Juan Antonio Gabaldón Estevan (presid.), Jordi Villà Freixa (secret.), Andrea Cavalli (voc.)
• Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Biomedicina por la Universidad Pompeu Fabra
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Biología humana
      • Genética humana
    • Biología vegetal (botánica)
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• Resumen

  • El propósito de mis estudios doctorales era desarrollar un algoritmo para el análisis a gran escala de conjuntos de datos de proteínas. Esta tesis describe la metodología, el trabajo técnico desarrollado y los casos biológicos envueltos en la creación del algoritmo principal –el cleverMachine (CM) y sus extensiones multiCleverMachine (mCM) y cleverGO. El CM y mCM permiten la caracterización y clasificación de grupos de proteínas basados en características físico-químicas, junto con la abundancia de proteínas y la anotación de ontología de genes, para así elaborar una exploración de datos correcta. Mi método está compuesto por científicos tanto computacionales como experimentales con una interfaz amplia, fácil de usar para un monitoreo y clasificación de secuencia de proteínas de alto rendimiento.