Relación estructura-función en la DNA polimerasa del bacteriófago phi291 papel del dominio intermedio de la proteína terminal en el reconocimiento específico de la DNA polimerasa

• Autores: Patricia Pérez Arnaiz
• Directores de la Tesis: Miguel Vega García (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad Autónoma de Madrid ( España ) en 2008
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: José Fernández Piqueras (presid.), Ana Bonnin Bioslada (secret.), María Antonia Blasco Marhuenda (voc.), Luis Blanco Dávila (voc.), Antonio Bernad Miana (voc.)
• Materias:
  • Química
    • Bioquímica
      • Genética bioquímica
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en: Biblos-e Archivo
• Resumen

  • El trabajo desarrollado ha permitido identificar y caracterizar funcionalmente una serie de residuos que actúan como ligandos de DNA en los centros activos de exonucleólisis y polimerización, siendo importantes para la unión y estabilización de la cadena iniciadora del dúplex DNA en ambos centros activos. Los residuos implicados en la estabilización de un ssDNA en el centro activo de exonucleólisis son también importantes para el mantenimiento de la fidelidad de síntesis.

    Se propone también un papel para el subdominio thumb de la DNA polimerasa en la coordinación de las actividades de síntesis y degradación. El estudio de residuos evolutivamente conservados en el centro activo de polimerización de las DNA polimerasas de tipo eucariótico ha permitido identificar dos nuevos ligandos de metal en dicho centro activo.

    Mediante la construcción de proteínas quiméricas de las proteínas terminales de phi29 y del bacteriófago relacionado GA-1, se propuso al dominio intermedio de la proteína terminal como el responsable del reconocimiento específico de la DNA polimerasa, a través de la región TRP-1 de ésta. Esta interacción es necesaria para que el dominio iniciador de la proteína terminal se sitúe en el centro activo de polimerización de la DNA polimerasa de manera catalíticamente competente.