Molecular recognition of glycomimetics by proteins a 3D view using NMR
- Autores: Silvia Mari
- Directores de la Tesis: Jesús Jiménez Barbero (dir. tes.)
- Lectura: En la Universidad Autónoma de Madrid ( España ) en 2006
- Idioma: inglés
- Tribunal Calificador de la Tesis: Juan Carlos Carretero Gonzálvez (presid.), Marta Bruix Bayes (secret.), Nazario Martín León (voc.), Sergio Castillón Miranda (voc.), María José Camarasa Ruis (voc.)
- Materias:
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- Resumen
Durante los últimos años se ha demostrado que los carbohidratos están ampliamente distribuido por la naturaleza y que desempeñan un elevado número de funciones biológicas.
Hoy en día está claro que el principal papel biológico de los carbohidratos es el de ser puntos específicos de reconocimiento molecular para lectinas, toxinas, enzimas y anticuerpos. De hecho los procesos de reconocimiento molecular carbohidrato/proteina intervienen en el plegamiento y maduración de las glicoproteínas, en la adhesión celular, en el control de crecimiento celular y en otras actividades celulares, como la embriogénesis.
Desde una perspectiva general, es obvio que para que el proceso de reconocimiento molecular tenga lugar, las estructuras tridimensionales del carbohidrato y del receptor juegan un papel primordial. Desde un punto de vista racional, y considerando los carbohidratos (o sus análogos sintéticos: glicomiméticos) como posibles fármacos, está claro que un conocimiento de sus estructura tanto en estado libre como asociado a su receptor es importante.
El conocimiento de la estructura tridimensional del carbohidrato en disolución sólo puede obtenerse mediante técnicas de Resonancia Magnéticas Nuclear (RMN). En caso favorables, el uso de RMN también puede permitir la determinación estructural completa de proteínas libres o de complejo proteína-carbohidrato. Sin embargo, se sabe que esta técnica experimental impone serios límites en los relativo al tamaño del sistema.
Éste límite está en torno a 100 residuos para proteínas sin marcaje siotópico, a 150 para aquellas etiquetadas con 15N y en torno a 300 para las doblemente (15N, 13C) marcadas. Sin embargo, aún en los caos en que el tamaño del sistema es demasiado grande para conseguir una determinación estructural completa, la RMN puede, en caso favorables, ofrecer información sobre la conformación del ligando en el centro de reconocimiento de la proteína; es decir, sobre la posible c
