El gen humano que codifica la proteína intercambiadora de aniones 2 (AE2) posee 23 exones y 22 intrones con una longitud total de 18 kb aproximadamente. El tamaño de los exones oscila entre las 90 pb del exón 18 y las 255 pb del exón 17, mientras que el de los intrones varía entre las 80 pb del intrón 4 y las 2161 pb del intrón 1.
Experimentos de "primer extension" y RACE 5' sugieren que el gen posee múltiples sitios de inicio de transcripción.
El extremo 5' del gen contiene la potencial región promotora, en la que se pueden observar numerosas secuencias consenso reguladoras de la transcripción.
Entre ellas se encuentran varias cajas GC, E, y CACC, así como un CRE. Sin embargo, no se observa caja TATA o iniciador.
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