Resumen de Single molecule localization microscopy reveals dna compaction and nascent rna structure in vivo
La organización de la cromatina y la expresión génica son interdependientes. Previamente, nuestro grupo mostró que los nucleosomas forman grupos llamados “clutches”, cuyo tamaño está correlacionado con el estado celular.
En esta tesis, se llevó a cabo microscopía de súper resolución en 3D y dos colores para poder obtener imágenes de histonas, ADN y ARN a una resolución nanoscópica. Se identificó el “clutch DNA” como aquel ADN cuya compactación es dependiente del “clutch”. Además, se estudió como el estado epigenético de los “clutches” altera el radio del “clutch DNA”. Se identificaron también nanodominios de ARN naciente, cuál es su ubicación dentro del radio del “clutch DNA”, y como la densidad de ARN está inversamente correlacionada con el tamaño del “clutch”.
Estos resultados proporcionan nuevas perspectivas en la organización de la cromatina a escala nanométrica, y muestran como los clutches afectan tanto el empaquetamiento de ADN como la actividad transcripcional.
