Integrative analysis of x-chromosome reactivation kinetics in a novel reprogramming system
- Autores: Moritz Bauer
- Directores de la Tesis: Bernhard Payer (dir. tes.)
- Lectura: En la Universitat Pompeu Fabra ( España ) en 2020
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Marc A. Marti-Renom (presid.), Marcus Buschbeck (secret.), Jose Silva (voc.)
- Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Biomedicina por la Universidad Pompeu Fabra
- Materias:
- Texto completo no disponible (Saber más ...)
- Resumen
La reactivación del cromosoma X inactivo tiene el potencial de proporcionar un sistema único para estudiar la formación de eucromatina inducida por el desarrollo. Sin embargo, la comprensión de este proceso se vio obstaculizada por la falta de sistemas adecuados, lo que permitiría la disección del proceso utilizando técnicas de secuenciación de alto rendimiento. Aquí describo el desarrollo de un nuevo sistema de reprogramación de células madre pluripotentes inducidas que permite el aislamiento de células preparadas para la reactivación de X, logrando posteriormente la eficiencia casi determinista de la reactivación de X. Utilizando este novedoso sistema, pudimos revelar que la reactivación de genes silenciados ocurre rápidamente y puede dividirse en distintas fases de iniciación y finalización. Del mismo modo, podríamos mostrar que la apertura de cromatina de la X inactiva se realiza en dos pasos, iniciando en las proximidades de regiones previamente abiertas, y posiblemente iniciada por factores de pluripotencia. Finalmente, podríamos mostrar que los mega-domains y los TADs corresponden a dos niveles diferentes de organización del genoma tridimensional superpuestos en el Xi, independientemente de la expresión génica. Llegamos a la conclusión de que la expresión génica y la accesibilidad a la cromatina durante la reactivación X comparten una cinética similar, mientras que la organización del genoma podría seguir principios distintos.
