Estudio biocomputacional de secuencias de beta-glucosidasas y glicosil hidrolasas estructuralmente relacionadas
- Autores: Antonio Rojas Pérez
- Directores de la Tesis: Antoni Romeu Figuerola (dir. tes.)
- Lectura: En la Universitat Rovira i Virgili ( España ) en 2000
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Lluís Arola Ferrer (presid.), Teresa Segués Piqué (secret.), Enrique Querol Murillo (voc.), Xavier Remesar Betlloch (voc.), Rafael Franco Fernandez (voc.)
- Materias:
- Texto completo no disponible (Saber más ...)
- Resumen
Las b-glucosidasas (EC 3.2.1.21) son enzimas que catalizan la hidrólisis de alquil y aril B-D-glueósidos y glicósidos como el disacárido celobiosa que contienen sólo resíduos de carbohidrato. Estas enzimas son miembros de las familias 1 y 3 de la super-familia de las glicosil hidrolasas, de la que se han descrito 81 familias en base a similaridades de secuencias de aminoácidos.
Además de las b-glucosidasas, las familias 1 y 3 incluyen otras flicosil hidrolasas de diferentes actividades enzimáticas. El objetivo de este estudio es contribuir al conocimiento de las relaciones evolutivas moleculares existentes entre las enzimas de estas familias, meidante el análisis combiando de sus secuencias de aminoácidos y de sus correspondientes DNA codificantes.
A apartir de las bases de datos se obtuvo un conjunto de secuencias de proteínas : 115 para la familia 1 y 66 para la familia 3. Los multialineamientos se llevaron a cabo usando los programas: PILEUP, disponible en el software del paquete informático GCG y CLUSTALW. El servidor on-line PREDICT-PROTEIN se utilizó para calcular la propensión de los resíduos al estado de hélice a, lámina b o lazo, para cada secuencia de aminoácidos.Este estudio computacional aporta un sumario de propiedades estructurales de estas enzimas, a través de los correspondientes multialineamientos y árboles filogenéticos. Se demuestra que el mecanismo evolutivo para ambas familias enzimáticas 1 y 3, es un proceso de divergencia parsimoniosa a partir de un antecesor común y se desarrolla un nuevo enfoque analítico en filogenia de proteínas, en orden a la correción de la degeneración del código genético.
Se describen diversos "frameshfts" en genes de B-glucosidasas de: Erwinia herbicola, Cellulomonas fimi, Triflium repens, Clostridium stercoraium y C. Thermocellum. Los resultados de la investigación ponen de manifiesto que el fen de la B-glucosidasa de Kluyveromyces failis ha sido adquirid
