Biología integrada de la infección y resistencia antimicrobiana de acinetobacter baumannii" y "acinetobacter pittii
- Autores: Itziar Chapartegui
- Directores de la Tesis: José Ramos Vivas (dir. tes.)
- Lectura: En la Universidad de Cantabria ( España ) en 2019
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Miguel A. Valvano (presid.), Alain A. Ocampo Sosa (secret.), Marta Hernández Pérez (voc.)
- Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Biología Molecular y Biomedicina por la Universidad de Cantabria
- Materias:
- Enlaces
- Tesis en acceso abierto en: UCrea
- Resumen
- español
Acinetobacter es un género de bacterias Gram negativas, en su mayoría de origen ambiental, que cuenta en la actualidad con más de 60 especies validadas. Algunas de las especies de este género tienen relevancia clínica por ser patógenos humanos, y su presencia se ha visto incrementada en los últimos años como causantes de infecciones nosocomiales tales como neumonías y bacteriemias. La especie más importante hasta el momento es A. baumannii, aunque existen otras como A. pittii y A. nosocomialis que también han adquirido relevancia clínica.
Pese a que estas bacterias son a veces consideradas de baja patogenicidad, su tratamiento supone un reto en la práctica clínica ya que son capaces de adquirir de manera rápida y eficaz resistencia a la mayoría de antimicrobianos, limitando de manera significativa las opciones terapéuticas. Este problema es tal que la Organización Mundial de la Salud (OMS) ha situado a A. baumannii como el principal patógeno contra el que hay una prioridad crítica para el desarrollo de nuevos antibióticos. Además, en el ambiente hospitalario presentan una gran capacidad de supervivencia y persistencia, pudiendo sobrevivir en condiciones de desecación y privación de nutrientes durante largos periodos de tiempo, lo que aumenta de manera significativa la probabilidad de contaminación e infección. Esto, ligado a la resistencia que presentan a desinfectantes y biocidas, y a la diseminación de determinantes de resistencia mediante plásmidos, hace que estos microorganismos sean muy difíciles de erradicar.
Por esto, el objetivo del presente trabajo ha sido estudiar la capacidad de supervivencia de cepas clínicas de A. baumannii y A. pittii bajo condiciones desfavorables y conocer si su virulencia se ve afectada tras largos periodo de estrés; así como realizar un análisis genómico de las mismas.
Para ello, se emplearon superficies propias de un hospital (como plástico, cristal o bata de laboratorio) con el fin de comparar la supervivencia de las bacterias en las diferentes condiciones; se empleó el modelo animal Galleria mellonella para ensayos de virulencia y suero humano con el fin de evaluar la resistencia de dichas bacterias al mismo. También se usaron plataformas de Illumina de PacBio para secuenciar los genomas de las bacterias a estudio, y analizar el resistoma y el contenido plasmídico de las mismas.
En lo que a supervivencia se refiere, las cepas de Acinetobacter fueron capaces de sobrevivir semanas en desecación y/o bajo privación de nutrientes; pese a no mostrar estrategias de supervivencia específicas como el denominado estado viable no cultivable. Se observó también que tras esas condiciones mantuvieron la capacidad de adherirse a superficies abióticas, que su virulencia sobre el modelo animal no disminuyó y que no perdieron la capacidad de resistir al suero humano.
Por otro lado, a nivel genómico todas las cepas mostraron una elevada homología y un gran repertorio de determinantes de resistencia. La presencia de plásmidos entre las cepas fue variable, así como el tamaño de los mismos.
Los resultados obtenidos en esta Tesis Doctoral respecto a la persistencia de Acinetobacter en el ambiente hospitalario nos han permitido aumentar el conocimiento acerca de los mecanismos de supervivencia de estas bacterias y la respuesta del organismo a las condiciones de estrés. También ha permitido incrementar la comprensión de la composición génica y genómica de estas dos especies bacterianas.
- English
Acinetobacter is a Gram negative bacterial genus, some of them being relevant human pathogens as cause of nosocomial infections (pneumonia, bacteraemia). Their treatment is a challenge in the clinical practice since they are capable of acquiring resistance to most antimicrobials in a fast way, as well as to disinfectants and biocides. In addition, they have a great capacity for survival and persistence in the environment, being able to survive in desiccation and starvation for long time, thus allowing the bacterial dissemination.
The objective of the present work was both to study the survival capacity of A. baumannii and A. pittii clinical strains under unfavourable conditions and to know if their virulence is affected after long periods of stress; as well as to perform a genomic analysis of the strains.
Acinetobacter strains were able to survive for weeks under stress conditions despite not showing survival strategies or reduction of their virulence. Moreover, they showed a high genomic homology and a large repertoire of resistance determinants. Both the presence and the size of plasmids between the strains were variable.
- español
