Quantitive trait loci and underlying candidate genes controlling agronomical and fruit quality traits in octoploid strawberry (fragaria x ananassa)

• Autores: Jassmine Zorrilla Fontanessi
• Directores de la Tesis: Iraida Amaya Saavedra (dir. tes.), José F. Sánchez Sevilla (codir. tes.)
• Lectura: En la Universidad de Málaga ( España ) en 2011
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Eduardo R. Bejarano (presid.), Rafael Fernández Muñoz (secret.), Sonia Osorio Algar (voc.), Antonio José Monforte Gilabert (voc.), Teresa Barreneche (voc.)
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• Resumen

  • El género Fragaria pertenece a la subfamilia Rosoideae (dentro de la familia de las Rosaceas) y engloba a 25 especies con distintos niveles de ploidia, existiendo desde especies diploides a especies decaploides. La fresa cultivada (F. x ananassa) es un octoploide con 56 cromosomas. En este trabajo de Tesis Doctoral se han desarrollado un total de 136 marcadores microsatélites (SSRs) génicos de Fragaria, 102 de F. x ananassa y 34 de F. vesca. El 78,7% de los marcadores desarrollados mostraron homología con secuencias que codifican protefnas y el 92,6% fueron polimórficos en distintos cultivares de fresa. De estos últimos, el 14,2% amplificaron 1 o 2 bandas, indicando que podrían ser específicos de un solo subgenoma. Mediante la estrategia de mapeo selectivo, se han localizado 80 nuevos marcadores SSRs a lo largo de los 7 grupos de ligamiento del mapa de referencia de Fragaria diploide. Tres de estos marcadores definieron nuevas regiones del mapa no descritas previamente. También se ha analizado la transferibilidad de 174 marcadores de Fragaria a los géneros Rosa y Rubus. El porcentaje de transferabilidad fue mayor a Rosa (27%) que a Rubus (19,5%) y, además, fue mayor para los SSRs génicos que para los genómicos. Por otro lado, empleando una población F1 segregante de 95 individuos generada a partir del cruce intraespecífico entre las selecciones de mejora '232' y '1392', se han identificado 33 QTLs para 14 caracteres agronómicos y de calidad del fruto de fresa. De ellos, aproximadamente el 37% fueron estables en dos o tres años y los porcentajes de varianza fenotípica explicados variaron entre el9.2% y el 30.5%. Sobre la misma población, se han detectado también 71 QTLs para 48 compuestos volátiles que contribuyen al aroma de la fresa. Aproximadamente el 50% de ellos fueron estables en dos o tres años y los porcentajes de variación fenotípica explicados variarion entre el 14,2% y el 92,8%, indicando que algunos de ellos son QTLs mayores determinados por un solo gen. Finalmente, en base a sus colocalizaciones y funciones putativas se han propuesto genes candidatos para QTLs que controlan producción, dureza del fruto, contenido en antocianas, contenido en ácido ascórbico y contenido en diversos compuestos volátiles.

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