Insights into cytoplasmic polyadenylation mediated by drosophila dicer-2
- Autores: Hima Priyanka Nadimpalli
- Directores de la Tesis: Fátima Gebauer Hernández (dir. tes.)
- Lectura: En la Universitat Pompeu Fabra ( España ) en 2017
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Raúl Méndez de la Iglesia (presid.), Sílvia Pérez Lluch (secret.), Cornelia H. de Moor (voc.)
- Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Biomedicina por la Universidad Pompeu Fabra
- Materias:
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- Resumen
La poliadenilación citoplasmática es un mecanismo de control de la traducción extendido a lo largo de la escala animal. En vertebrados, este mecanismo requiere dos secuencias en el extremo 3’ no traducido (UTR) del mRNA, el elemento de poliadenilación citoplasmática rico en uridinas (CPE) y el hexanucleótido de poliadenilación AAUAAA (HN). En embriones tempranos de Drosophila, la poliadenilación de Toll, sin embargo, ocurre independientemente de estas secuencias, y requiere al menos dos factores: Dicer-2, una proteína previamente implicada en interferencia de RNA (RNAi), y la poly(A) polimerasa Wispy.
Para entender esta nueva función de Dicer-2 en poliadenilación citoplasmática y traducción, nos propusimos diseccionar los elementos en el extremo 3’ UTR de Toll relevantes para este mecanismo de poliadenilación no canónica, así como identificar proteínas y mRNAs que interaccionan con Dicer-2 a gran escala. Nuestros resultados indican que el extremo 3’ UTR de Toll contiene varias secuencias implicadas en poliadenilación, y que el mecanismo no canónico es dominante en embriones tempranos, probablemente porque los elementos canónicos (CPE y HN) se encuentran activamente reprimidos. El estudio del interactoma de Dicer-2, realizado por purificación por afinidad e identificación por espectrometría de masas, reveló numerosas proteínas que no están implicadas en RNAi. Entre ellas, encontramos factores previamente relacionados con control de la longitud del poly(A) o con interacción con PABP y traducción, sugiriendo que estos factores podrían actuar como co-factores de Dicer-2 en poliadenilación citoplasmática. Análisis de mRNA targets mediante RIP-Seq reveló multiples tránscritos que previamente fueron identificados como targets de Wispy. Estos resultados sugieren una función extendida de Dicer-2 en poliadenilación citoplasmática, y establecen una base sólida para investigaciones futuras.
