Funció de las proteïnes associades al nucleoide hns i hha en la regulació de l' expressió génica global a salmonella. Estudi per dna array
- Autores: Aitziber Vivero Larraza
- Directores de la Tesis: Antonio Juárez Giménez (dir. tes.), Cristina Madrid Xufré (codir. tes.)
- Lectura: En la Universitat de Barcelona ( España ) en 2010
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Francisco J. M. Mojica (presid.), Sònia Paytubi Casabona (secret.), Lidia Sevilla Fortes (voc.)
- Materias:
- Texto completo no disponible (Saber más ...)
- Resumen
Partiendo de la información previa sobre la interacción entre las proteínas de la família Hha y proteínas de tipo H-NS, se planteó en este trabajo analizar el papel regulador de dichas proteínas en Salmonella enterica serovar Typhimurium, mediante el uso de microarrays de DNA. El análisis transcriptómico de mutantes en proteína de tipo Hha (hha ydgT) indica que un gran nombre de los genes que muestran una alteración en su expresión se localizan en secuencias ricas en AT, adquiridas de forma horizontal (HGT). La comparación con los genes afectados por una mutación hns demuestra que un elevado porcentage de genes afectados por una mutación hha ydgT también lo estan por una mutación hns. Así, de entre los genes regulados por H-NS, una parte estarian también regulados por proteínas de tipo Hha, principalmente genes de tipo HGT. Las proteínas Hha y H-NS también pueden estar codificadas en plásmidos. Este es el caso del plásmido R27, plásmido que presenta una conjugación termosensible controlada por Hha y H-NS. Hemos estudiado también en este trabajo el papel regulador de las proteínas Hha y H-NS de codificación plasmídica. Se ha analizado si la proteína H-NS de codificaión plasmídica es funcionalmente equivalente a la proteína H-NS de codificación cromosómica. Mediante análisis transcriptómicos, se ha comprobado que la proteína H-NS de codificación plasmídica no ejerce función reguladora sobre el total de genes regulados por H-NS, sino que su función se reduce a un conjunto de genes situados predominantemente en islas de patogenicidad y plásmido de virulencia, secuencias de DNA de adquisición horizontal, mientras que otros genes regulados por H-NS no se ven afectados por la proteína de codificación plasmídica.
Los resultados obtenidos en este trabajo, juntamente con datos publicados por otros autores, sugieren que los genes regulados por la proteína H-NS podrian estar divididos en dos categorias o grupos: genes modulados por la proteína H-NS de codificación cromosómica, mayoritariamente genes del núcleo del genoma,. Y genes para los que la regulación por H-NS requiere la interacción de dicha proteína con proteínas de tipo Hha para la formación de complejos reguladores eficientes. Muchos de estos genes se localizan en secuencias de DNA de adquisición horizontal. De forma generalizada, los genes sensibles a complejos H-NS/Hha, son a la vez sensibles a la modulción por proteínas de tipo H-NS de codificación plasmídica, como la proteína H-NS codificada en el plásmido R27.
