La contaminación del ambiente por microorganismos patógenos representa un riesgo en la salud humana y animal cuando estos microorganismos están presentes en aguas de recreo o de consumo y en los alimentos. Gran cantidad de virus son excretados en las heces y orinas de humanos y animales e incluso en concentraciones bajas, pueden provocar enfermedades. Algunos de estos virus tradicionalmente no han sido monitorizados como enfermedades transmisibles por el agua y son considerados patógenos emergentes.
Las familias Adenoviridae y Poliomaviridae comprenden una amplia diversidad de virus que son excretados durante largos periodos en heces y orina de humanos y animales.
Esta tesis doctoral tiene como objetivo principal el estudio de adenovirus y poliomaviurs como contaminantes ambientales y el desarrollo de marcadores de contaminación fecal ambiental de origen animal. El trabajo aquí presentado se ha iniciado con el estudio de la contaminación de origen porcino y bovino, y actualmente es una línea abierta a futuros estudios para identificar otras fuentes de contaminación fecal de origen animal. Se ha pretendido también profundizar en el conocimiento de adenovirus y poliomavirus y en su filogenia. En este sentido se enmarca el último cápitulo de tesis en el que se ha estudiado un adenovirus aislado de monos Cynomolgus y que puede ser interesante para conocer la evolución y filogenia de los adenovirus.
El trabajo desarrollado se ha dividido en cuatro partes: (i) determinar la excreción, presencia y prevalencia de los virus humanos y animales HAdV, PAdV, HPyV y BPyV en el ambiente. (ii) Desarrollar y aplicar métodos de cuantificación de adenovirus porcinos (PAdV) basados en PCR a tiempo real (qPCR). (iii) Desarrollar y aplicar métodos de cuantificación de BPyV mediante qPCR. (iv) Caracterizar genéticamente un nuevo adenovirus de simio mediante el análisis de las secuencias de 4 genes, diferentes.
Los resultados obtenidos en este trabajo muestran que el nivel de excreción de los virus animales analizados es elevado. Además, el patrón de la excreción de los poliomavirus bovinos y poliomavirus humanos JC parece ser similar. Los resultados obtenidos indican que la técnica de qPCR permite cuantificar PAdV y BPyV en diferentes muestras ambientales, incluidas muestras de agua y suelos con contaminación producida por fertilizantes o abonos procedentes de centros de explotación animal. En términos generales, los datos presentados en este trabajo proporcionan un instrumento cuantitativo para el análisis de PAdV y BPyV como indicadores de la contaminación de origen porcino y bovino en el ambiente, respectivamente y apoya el uso de qPCR para la detección de PAdV y BPyV, junto con los marcadores humanos HAdV y JCPyV como instrumento valioso para rastrear la fuente y origen de la contaminación.
El segundo objetivo global de la tesis ha sido el profundizar en el estudio de la diversidad y la filogenia de adenovirus y poliomavirus. En esta línea se encuentra el último cápitulo de la tesis que se presenta.
Finalmente, nuevos datos sobre prevalencia, excreción y cepas circulantes de poliomavirus bovinos y adenovirus porcinos han sido generados en esta tesis.
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