Los virus entéricos humanos se convierten en contaminantes del medio acuático debido a que son excretados en grandes cantidades por los individuos infectados y a que los mecanismos de depuración de aguas residuales actuales no aseguran una completa eliminación de los mismos. Un importante número de los brotes de gastroenteritis de origen hídrico documentados están relacionados con norovirus y sapovirus humanos. Se realizó un estudio de la cuenca del río Llobregat basado en un muestreo mensual de diferentes puntos a lo largo del mismo, con el objetivo de estudiar el papel de estos virus como contaminantes biológicos de nuestros ríos. Además, se estudiaron también muestras procedentes de una estación depuradora de aguas residuales (E.D.A.R.) y de una planta de tratamiento que emplea el mencionado río como fuente para la producción de agua potable. Todas las muestras se concentraron y se sometieron a técnicas de Real-Time RT-PCR específicas para detectar ambos virus. Se detectaron elevadas concentraciones de norovirus y sapovirus tanto en muestras de aguas residuales como de agua de río. Todas las muestras de agua de consumo resultaron negativas para ambos virus. Tanto norovirus como sapovirus fueron detectados a lo largo de casi todo el período de estudio, con una mayor concentración general durante la estación fría. Se observó un claro descenso en la concentración de ambos virus en los meses de verano (Julio y Agosto) en todas las clases de muestras positivas. Ambos virus se mostraron parcialmente resistentes al efecto depurador de los procesos de la E.D.A.R. estudiada. El genotipo de sapovirus más prevalente fue el GI.2. En el caso de norovirus el genotipo más prevalente fue el GI.4, seguido del GII.4 y del GII.21. Se detectaron además por primera vez en el medioambiente, diferentes variantes de la cepa pandémica de GII.4, corroborando su circulación en la población.
Entre los diferentes orígenes de la infección por el virus de la hepatitis A (HAV), destaca la introducción del virus desde áreas endémicas mediante el consumo de alimentos contaminados, los viajes a dichos destinos y los flujos de inmigración desde los mismos. Otro de los grupos de riesgo son los hombres homosexuales activos (MSM), entre los cuales han tenido lugar importantes brotes en diferentes países de Europa. En este contexto se realizó un estudio de muestras de pacientes IgM+ para el HAV provenientes de casos esporádicos y brotes ocurridos en nuestra comunidad autónoma en el período 2005-2009. Por otro lado, se quisieron estudiar también las características antigénicas de las cepas circulantes del virus con el objetivo de conocer su potencial para actuar como reservorio de nuevas variantes antigénicas que pudieran escapar a la protección ofrecida por las vacunas actuales. Para ello, las cepas aisladas en el estudio epidemiológico se caracterizaron molecularmente y sus secuencias de aminoácidos se compararon con las de las cepas HM-175 y GBM, constituyentes de dos de las vacunas comerciales. En el estudio epidemiológico, la mayoría de cepas aisladas se pudieron caracterizar como relacionadas con viajes, inmigración e importaciones de alimentos desde áreas endémicas, además de cepas endémicas circulantes en la población MSM. El 48% de las cepas pertenecían al genotipo IA, el 40% al genotipo IB y el 2% al genotipo IIIA. El 10% restante pertenecía a un subtipo indeterminado equidistante del los genotipos IA y IB que nosotros proponemos como IC. Entre todas estas cepas se aislaron seis variantes antigénicas potencialmente capaces de escapar a la protección ofrecida por dos vacunas actuales, la mayoría de ellas en el grupo MSM. Estos datos muestran la necesidad de completar adecuadamente los calendarios de vacunación, especialmente entre la población inmunocomprometida, lo que resulta crítico para prevenir la emergencia de variantes capaces de escapar a las vacunas actuales.
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