Resumen de Filogènia i perspectiva evolutiva dels protistes opistoconts
Para entender el origen de los opistocontos (grupo taxonómico que contiene animales, hongos y protistas emparentados) o inferir sus transiciones evolutivas es fundamental entender primero las relaciones filogenéticas entre las especies existentes en la actualidad. La filogenia, particularmente la filogenómica (como el método de la supermatriz), es el procedimiento más adecuado para inferir las relaciones evolutivas entre especies. Relaciones como la morfología, la sinapomorfías moleculares o variaciones genéticas singulares son argumentos cíclicos dependientes del muestreo taxonómico. Por esta razón, hemos usado información genómica y transcriptómica para construir un dataset formado por dominios proteicos de una sola copia y los hemos analizado usando varios métodos permitiéndonos evitar los errores sistemáticos. Con ello, hemos confirmado la división existente entre Holomycota (Nucleariids, Opisthosporidia, quitridiomicetos y hongos) y Holozoa (Ichthyosporea, Filasterea, Choanomonada y Metazoa). También hemos obtenido datos de RNAseq para situar especies particularmente ambiguas como: Corallochytrium limacisporum la cual hemos definido como un grupo hermano de Ichthyosporea, otro grupo holozoa osmotrófico. Basándonos en este background filogénetico robusto podemos empezar a especular sobre las transiciones evolutivas entre los grupos. No obstante antes hizo falta reconstruir los ancestros de los linajes de los opisthokonta como también sus outgroups actuales: Apusomonadida and Breviatea. Los resultados indican que no existe relación clara entre los bacteriofagos ancestros biflagelados (el outgroup) y los linajes de opisthokonta (ingroup). También que el último antepasado común de los opistocontos probablemente conservaría casi todos los caracteres ancestrales como el movimento ameboide, los filopodia, la fagotrofía, etc.; pero sería uniflagelado, con una forma celular menos limitada por el tipo de alimentacion. Mediante la genómica comparada se pueden estudiar las similitudes entre grupos no-emparentados de los opistocontos como los osmótrofos con pared celular o las amebas filosas nudas. Por ejemplo, hemos descubierto que Ministeria vibrans (Filasterea) y C. limacisporum (Ichthyosporea) poseen un aparato flagelar hasta ahora desconocido y con un patrón parecido al que usan hongos y otros eucariotas. También que Ichthyosporea usa un material símil de la quitina para construir su pared celular.
