Resumen de Estudio teorico del mecanismo de reacción de la enzima catecol o metiltransferasa
La Tesis Doctoral, consiste en un estudio de la reacción de transferencia de medio entre el cofactor S-adenosilmetionian (SAM) y el sustrato catecolato mediante la metodología híbrida Mecánica Cuántica/Mecánica Molecular (Quatum Mechanical/Molecular Mechanical, QM/MM).
Inicialmente se ha explorado y caracterizado la superficie de energía potencial mediante el empleo de la combinación de los programas CHARMM/GRACE y posteriormente se ha obtenido el perfil de energía libre tanto en medio enzimático como en disolución acuosa mediante el uso del programa DYNAMO. Tras un análisis de la reorganización de la enzima y la preorganización del sustrato sobre esta reacción SN2 se ha esclarecido su contribución en la catálisis. Además, a partir de la evolución del efecto dinámico de la reacción se ha obtenido una estimación de las desviaciones de la Teoría del Estado de Transición y también se ha podido explicar su contribución en la catálisis enzimática.
Por último, se han calculado los Efectos Isotópicos Cinéticos y los resultados obtenidos se han comparado con los datos experimentales. La concordancia de los valores nos permite establecer una metodología general de trabajo para llevar a cabo el estudio de reacciones químicas en medios condensados.
