Structural and thermodynamic properties of biomolecules from molecular dynamics simulations. Application to the study of the protein inhibitor of carboxypeptidases, pci

• Autores: Xavier Daura i Ribera
• Directores de la Tesis: Francesc Xavier Avilés Puigvert (dir. tes.)
• Lectura: En la Universitat Autònoma de Barcelona ( España ) en 1996
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: M. Lluch Jose (presid.), Baldomero Oliva (secret.), Modesto Orozco López (voc.), E. Mark Alan (voc.), Javier Luque Francisco (voc.)
• Materias:
  • Química
    • Bioquímica
      • Bioquímica física
    • Química macromolecular
      • Polipéptidos y proteínas
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• Resumen

  • Se han utilizado metodos de simulacion de dinamica molecular para el estudio de la estructura y la dinamica en disolucion en agua del inhibidor proteico de carboxipeptidasas pci. Se han estudiado tambien las termodinamicas relativas de enlace a la carboxipeptidasa a (cpa) del pci nativo y del mutante del pci va138a1a. Finalmente, tambien se han estudiado aspectos metodologicos de las simulaciones de dinamica molecular, incluiendo el analisis del campo de fuerzas utilizado y la evaluacion de diferentes factores que pueden afectar los resultados de calculos computacionales de variaciones de energia libre para mutaciones de grupos quimicos de la proteina.