Cartografía física de marcadores moleculares polimórficos en drosophila buzzatii: utilización de random amplified polymorphic dnas (rapds) y generación de sequence tagged sites (stss)

• Autores: Hafid Laayouni
• Directores de la Tesis: Mauro Santos (dir. tes.), Antonio Fontdevila (codir. tes.)
• Lectura: En la Universitat Autònoma de Barcelona ( España ) en 2000
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Lluís Serra Camó (presid.), M. Antonia Velázquez Henar (secret.), María Jesús Puertas Gallego (voc.), Amparo Latorre (voc.), Armando Sánchez Bonastre (voc.)
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Genética
    • Biología molecular
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• Resumen

  • Se elaboró un mapa físico del genoma de Drosophila buzzatii basado en maracadores moleculares polimórficos: Random Amplified Polymorphic DNAs (RAPDs) y Sequence Tagged Sites (STSs). Se ensayaron 83 cebadores aleatorios de 10 nucleótidos, de los cuales 44 produjeron 144 RAPDs polimórficos y reproducibles.Estos RAPDs fueron hibridados in situ sobre los cromosomas politénicos de D. Buzzatii. Un total de 73 RAPDs cartografiaron en una posición única, 35 hibridaron en 2 o más posiciones, y 36 RAPDs no produjeron señal de hibridación detectable. La mayoría de los marcadores obtenidos (68%) cartografiaron enlso cromosomas 2 y 4. La distribución de los RAPDs conel cromosoma 2 resultó ser aleatoria, mientras que en el cromosoma 4 se detectó una agrupación mayor a de lo esperado por azar. Uno de los RAPDs cartografió cerca del punto de rotura proximal de la inversión 2z3 y fue hibridado in situ sobre las ordenaciones 2st y 2jz3. Los resultados indican que este marcador no está incluido en el segmento invertido, aunque pudo detectarse que el punto de rotura distal de la inversión 2z3 no coincide con el descrito previamente.

    Se obtuvieron un total de 38 STSs, que representan un valor agregado de 27,982 pb con un contenido G+C promedio del 41,5%. Estos STSs fueron comprados con las secuencias descritas de las bases de datos, observándose similitudes significativas en 15 casos. Estas secuencias mostraron un parecido elevado con genes previamente descritos en Drosophila, o con genes descritos en otros taxones, siendo posible inferir homología para dos de ellas. La búsqueda de pautas abiertas de lectura (ORFs) reveló la presencia de regiones codificadoras pertenecientes a hipotéticos genes no descritos hasta el momento. La comparación de la localización citológica de los STSs y de las secuencias con las cuales mostraron similitud, confirmó la conservación de las homologías cromosómicas postuladas y permitió sugerir la pos