Las isoformas de CD44 se originan por mecanismos de splicing alternativo de la región central (exones v2-v10) de su pre-mRNA. En el primer bloque del trabajo se ha utilizado el carcinoma de mama humana como modelo para describir las vias de splicing alternativo que actuan en esta región ,las cuales explican el conjunto de isoformas de CD44 expresadas en este tejido.
La via general de splicing alternativo induce la exclusión de los exones de la región variable en sentido 5¿-3¿,dirigiéndose a la sintesis de CD44H, exenta de exones variables. Este sistema aparece desregulado en el carcinoma, ya que se observa la inclusión gradual y progresiva de los exones de 3¿a 5¿, y a la aparición de isoformas de mayor peso molecular. Es un efecto posicional, correspondiente a un mecanismo de control de splicing alternativo que podría ser compartido por otros genes implicados en metástasis. La segunda via promueve la inclusión del exón variable 3, y se mantiene en ambos casos, fisiológico y patológico. En el segundo bloque de la tesis se describe el uso de nuevos splice sites 3¿de los exones variables 5 y 7 del CD44, fenómeno que confiere mayor variabilidad a la proteína. El tercer bloque aborda una primera aproximación a la caracterización de los elementos cis-reguladores de la inclusión específica del exón variable 3 del CD44 en el tejido mamario humano. Se ha visto que la longitud de los intrones flanqueantes de v3 es un determinante de la exclusión mayoritaria de este exón en el mRNA, y se han acotado las posiciones de almenos dos enhancers de splicing de v3.
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