Caracterizacion molecular de grandel, un nuevo tipo de retrotransposon del genero zea
- Autores: Carlos M. Vicient Sánchez
- Directores de la Tesis: José Antonio Martínez Izquierdo (dir. tes.)
- Lectura: En la Universitat de Barcelona ( España ) en 1995
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Antonio Fontdevila (presid.), Silvia Atrian Ventura (secret.), Michel Delseny (voc.), Josep Maria Casacuberta i Suñer (voc.), Andrés Moya (voc.)
- Materias:
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- Resumen
EL ANALISIS DE UNA FAMILIA DE SECUENCIAS REPETIDAS DISPERSAS PRESENTES EN EL GENOMA DE ZEA DIPLOPERENNIS DENOMINADAS ZRLE HA DADO COMO RESULTADO EL DESCUBRIMIENTO DE UN NUEVO RETROTRANSPOSON QUE HEMOS DENOMINADO GRANDE1.
GRANDE1 SE ENCUENTRA EN TODAS LAS ESPECIES DE LOS GENEROS ZEA Y TRIPSACUM, PERO NO EN ESPECIES TAN CERCANAS COMO EL SORGO. LA SECUENCIACION DE UNA COPIA COMPLETA DE GRANDE1 HA PERMITIDO LA IDENTIFICACION DE TODAS LAS CARACTERISTICAS PROPIAS DE ESTE TIPO DE ELEMENTOS, INCLUYENDO: LA DUPLICACION DE LA DIANA DE INSERCION, LAS REPETICIONES TERMINALES LARGAS (LTR), LOS SITIOS INICIADORES DE LA SINTESIS DE LAS DOS CADENAS DEL CDNA (PBS Y PPT), ASI COMO REGIONES SIMILARES A CADA UNO DE LOS DOMINIOS CODIFICANTES TIPICOS DE LOS RETROTRANSPOSONES (GAG, PROTEASA, TRANSCRIPTASA INVERSA, RNASAH E INTEGRASA). LA EXISTENCIA DE LTRS Y DE UN DOMINIO QUE CODIFICA LA TRANSCRIPTASA INVERSA SE CONSIDERAN CARACTERISTICAS SUFICIENTES PARA DEFINIR A UNA SECUENCIA COMO RETROTRANSPOSON. ADEMAS DE ESTAS CARACTERISTICAS TIPICAS, GRANDE1 PRESENTA UNA SERIE DE ESTRUCTURAS QUE NO SON NADA USUALES ENTRE LOS RETROTRANSPOSONES. UNA DE ESTAS CARACTERISTICAS ES EL TAMAÑO, YA QUE LA COPIA DE GRANDE1 SECUENCIADA POSEE 13.769 PB, LO QUE SIGNIFICA QUE GRANDE1 ES EL RETROTRANSPOSON DE MAYOR TAMAÑO DE LOS CARACTERIZADOS HASTA LA FECHA. ESTE GRAN TAMAÑO ES CONSECUENCIA DE LA EXISTENCIA DE UNA REGION 3' INUSUALMENTE GRANDE (7 KB) SITUADA TRAS LOS DOMINIOS CODIFICANTES. EN ESTA REGION EXISTEN DOS AGRUPACIONES DE SECUENCIAS REPETIDAS EN TANDEM DE LAS QUE SE DESCONOCE SU FUNCION. POR ULTIMO, JUNTO A LA LTR DE 3' EXISTE UNA SECUENCIA QUE PRESENTA TODAS LAS CARACTERISTICAS DE UN GEN. UTILIZANDO SONDAS CORRESPONDIENTES A ESTA ZONA HA SIDO POSIBLE DETECTAR UN RNA DE 0,9 KB PRESENTE EN TODOS LOS TEJIDOS DE MAIZ. EL EXAMEN DE LA SECUENCIA DE AMINOACIDOS DEDUCIDA DE ESTE POSIBLE GEN NO HA REVELADO SIMILITUD NINGUNA CON LOS BANCOS DE SECUENCIA. ALGUNOS DATOS INDI
