Resumen de Dna-gyrase a model peptides as potential probes to evaluate the antibacterial activity of quinolones: desing, synthesis and interaction studies
Con la intención de profundizar y entender mejor las interacciones que suceden a nivel molecular entre el ADN, las quinolonas y el enzima girasa se han diseñado y sintetizado diversos peptidos, modelos de girasa, que han sido utilizado como banco de prueba en el estudio por diversas técnicas biofísicas de las dichas interacciones. Así pues se han sintetizado en fase sólida ocho peptidos que contienen los fragmentos 75-92 i 116-130 de la unidad GyrA de la girasa de Escherichia Coli. Se han provocado diversos protocolos y se han introducido múltiples modificaciones con el objetivo de optimizar estos protocolos y mejorar los rendimientos globales. Aunque las secuencias demostraron su dificultad de síntesis, finalmente se consiguieron obtener los peptidos con buenos rendimientos (43%) estableciendo un protocolo de síntesis óptimo. El comportamiento de cuatro de estos peptidos en presencia de ADN ha sido estudiado por dicroismo molecular, determinando sus constantes de afinidad. Estos peptidos también han sido objeto de estudio estructural mediante la mencionada técnica. Así mismos se ha estudiado el complejo ternario formado por ADN, peptido y ciprofloxacina determinado cualitativamente su interacción y validando el péptido como modelo del enzima natural para este tipo de estudios. La interacción entre ciprofloxacina y los peptidos se ha estudiado por espectroscopia de fluorescencia, determinando las constantes de afinidad. Al actividad de los peptidos frente a ADN ha sido ensayada y comparada con la actividad del enzima natural. Así mismo se ha ensayado la actividad topoisomerasica de complejos formados por péptido y la subunidad GyrB con la intención de evaluar los residuos eliminados respecto GyrA. Los peptidos han demostrado no tener actividad topoisomerasica como era previsto y que no girasa por el ADN. Aun así, se ha demostrado su interacción con ADN, interacción que es sensible a mutaciones en su secuencia. Mediante todas las técnicas biof
