Analisi de variants génétiques mitjançant ngs en pacients ami distròfies de retina. Transcriptoma (rnaseq) diferencial de cel·lules de retina (rpe) induïdes in vitro amb mutació en el factor de splicing prpf8

• Autores: Beatriz Pascual Rodríguez
• Directores de la Tesis: José Miguel Carballo Villarino (dir. tes.), Pere Suau León (tut. tes.)
• Lectura: En la Universitat Autònoma de Barcelona ( España ) en 2018
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Ana Dopazo González (presid.), Inmaculada Ponte Marull (secret.), José María Millán Salvador (voc.)
• Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Bioquímica, Biología Molecular y Biomedicina por la Universidad Autónoma de Barcelona
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Biología molecular
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en:  TESEO  TDX 
• Resumen

  • Les distròfies de retina (DR) són un grup malalties rares que provoquen una degeneració dels fotoreceptors i posterior pèrdua de visió; dins de les quals, la Retinosis Pigmentària (RP) és la majoritària. Són malalties amb gran heterogeneïtat genètica i les mutacions associades es troben tan a gens específics de retina, com a gens d’expressió ubiqua, com són els factors de splicing o PRPFs, que causen formes de RP autosòmica dominant (adRP).

    Gràcies a les tècniques de seqüenciació massiva (NGS), s’ha dissenyat un panell propi de 107 gens associats a DR. La validació del panell i utilització de forma rutinària al laboratori, ha permès el diagnòstic molecular de les DR en pacients. Per a la recerca i caracterització de nous gens candidats a ser responsables de adRP en famílies que no es van resoldre mitjançant el panell de DR, es va utilitzar la tècnica de Whole Exome Sequence (WES). Mitjançant WES es va resoldre una de les 4 famílies en estudi. S’han obtingut cèl·lules iPSCs derivades de fibroblasts dèrmics d’un pacient adRP amb mutació en el factor de splicing PRPF8. Aquestes cèl·lules s’han pogut diferenciar a cèl·lules d’epiteli pigmentari retinià (RPE), permetent així la obtenció d’un model cel·lular in vitro per poder estudiar els mecanismes moleculars que provoquen la malaltia. Mitjançant la tecnologia RNA.seq, s’ha pogut observar per primera vegada, diferències significatives en l’expressió de gens e isoformes (especialment amb retenció d’introns) en cèl·lules específiques de retina (RPE) amb PRPF8 mutat. Aquestes diferències no es van observar en altres tipus cel·lulars, com fibroblasts dèrmics. Per primera vegada es mostra un mecanisme molecular diferencial en cèl·lules de retina, induït per una mutació en el factor de splicing PRPF8. Aquest mecanisme podria relacionar-se amb el desenvolupament de la adRP en el pacient.