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Gene expression variation and constraint across organs and species

  • Autores: Alessandra Breschi
  • Directores de la Tesis: Roderic Guigó Serra (dir. tes.)
  • Lectura: En la Universitat Pompeu Fabra ( España ) en 2016
  • Idioma: español
  • Tribunal Calificador de la Tesis: Ross Harrison (presid.), Manuel Irimia Martínez (secret.), Jennifer Harrow (voc.)
  • Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Biomedicina por la Universidad Pompeu Fabra
  • Materias:
  • Texto completo no disponible (Saber más ...)
  • Resumen
    • Los ratones son los principales organismos modelos para estudiar la biología y las enfermedades humanas, pero aún está en debate el nivel de conservación molecular entre humanos y ratones. Con el progreso de las tecnologías de secuenciación masiva, la transcriptómica comparativa ha llegado a una resolución sin precedentes. En esta tesis confirmamos que los transcriptomas de humano y ratón están globalmente conservados y identificamos y caracterizamos las propiedades de un conjunto de genes con expresión parecida entre las dos especies. Además, demostramos que diferentes tejidos de humanos, ratones y otros vertebrados se agrupan en base a su expresión génica segón los genes y las muestras incluidas en el análisis. Finalmente, analizamos la expresión génica de líneas celulares primarias humanas para investigar cómo las unidades funcionales de los órganos afectan la expresión de todo un órgano entero. De hecho, los estudios comparativos actuales tienen como limitación que se basan en datos de órganos enteros.


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