LA DEGRADACION INTRACELULAR DE PROTEINAS ES UN PROCESO QUE AFECTA A TODAS LAS PROTEINAS CELULARES Y SE CARACTERIZA FUNDAMENTALMENTE POR SER UN PROCESO ESPECIFICO Y REGULADO, DE MODO QUE EXISTE UNA GRAN VARIABILIDAD EN LAS VELOCIDADES DE DEGRADACION DE LAS PROTEINAS. EL OBJETIVO PRINCIPAL DE LOS ESTUDIOS SOBRE DEGRADACION DE PROTEINAS ES CONOCER DONDE RADICA LA SELECTIVIDAD DEL PROCESO. EN ESTE TRABAJO SE HA ESTUDIADO LA DEGRADACION DE DOS GRUPOS DE PROTEINAS MUY BIEN DIFERENCIADOS EN CUANTO A SUS CINETICAS DE DEGRADACION:
LAS PROTEINAS DE VIDA MEDIA CORTA (CUYA PROPORCION NO SUPERA EL 1% DE LA PROTEINA TOTAL), QUE SE DEGRADAN CON UNA VIDA MEDIA DE 1,5 A 2 HORAS, Y LAS PROTEINAS DE VIDA MEDIA LARGA, CON UNA VIDA MEDIA DE UNAS 80 HORAS. AMBOS GRUPOS DE PROTEINAS SE DEGRADAN POR MECANISMOS DIFERENTES. LAS PROTEINAS DE VIDA MEDIA CORTA SON MAS SUSCEPTIBLES A LA PROTEOLISIS "IN VITRO" Y SUS SUBUNIDADES SON, APARENTEMENTE, LAS MISMAS (CUANDO SE ESTUDIAN EN GELES DE POLIACRILAMIDA SODIO DODECIL SULFATO). PUESTO QUE LOS EXPERIMENTOS DE FILTRACION EN GEL MUESTRAN QUE LAS PROTEINAS DE VIDA MEDIA CORTA TIENEN MASAS MOLECULARES MENORES QUE LAS PROTEINAS DE VIDA MEDIA LARGA, AL MENOS UNA PARTE DE LAS PROTEINAS DE VIDA MEDIA CORTA DEBEN SER POLIPEPTIDOS RECIEN SINTETIZADOS QUE NO HAN FORMADO LAS ESTRUCTURAS SUPERIORES DE LAS PROTEINAS Y SON RAPIDAMENTE DEGRADADOS. DE HECHO, UNA PROTEINA ESPECIFICA (POR EJ. GLICERALDEHIDO 3-FOSFATO DESHIDROGENASA O TUBULINA) PUEDE PRESENTAR UNA DOBLE CINETICA DE DEGRADACION.
TAMBIEN SE HA DESARROLLADO EN ESTA TESIS UN MODELO "IN VITRO" DE DEGRADACION DE PROTEINAS POR LISOSOMAS, LA MICROAUTOFAGIA "IN VITRO". ESTE MECANISMO DE DEGRADACION ES CAPAZ DE RECONOCER CON SELECTIVIDAD LAS PROTEINAS Y ES COMPATIBLE CON UNA REGULACION DE LA DEGRADACION INTRACELULAR DE PROTEINAS POR MODIFICACIONES COVALENTES Y NO COVALENTES DE LAS PROTEINAS. POR ELLO, PODRIA EXPLICAR LAS DIFERENTES VIDAS MEDIAS DE LAS PROTEINAS Y SU VAR
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