Las quinasas dependientes de ciclinas (CDKs) juegan un papel importante en la regulación de la división del ciclo celular, lo que supone una prometedora diana para el desarrollo de nuevos agentes antineoplásicos. Se ha realizado un gran esfuerzo durante los últimos años en la búsqueda de pequeñas moléculas que pueden actuar como inhibidores químicos de las CDKs.En el presente trabajo se ha llevado a cabo un estudio teórico de la interacción entre CDK2 y diversos inhibidores químicos. Para ello se han utilizado diferentes técnicas de modelado molecular como estudios de docking flexible y simulaciones de dinámica molecular.Los ligandos objeto de estudio pertenecen a dos familias estructurales, por un lado la butirolactona I y sus derivados sintéticos, y por otro los derivados de la pirazolo[3,4-c]piridazina.La butirolactona I es un compuesto natural que actúa como inhibidor selectivo frente a CDK1 y CDK2 compitiendo por el sitio de unión del ATP. Un derivado de la pirazolo[3, 4-c]piridazina fue descubierto en un screening ciego llevado a cabo por BASF Pharma y presenta un interesante perfil como inhibidor selectivo de CDK2. Los resultados del trabajo nos han permitido establecer la relación estructura-actividad para ambas series de compuestos.
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