Resumen de Assessment of 5-fluorouracil (5fu) as a potential antiviral therapy: characterization of hepatitis c virus quasispecies in patients undergoing 5fu adjuvant therapy for colorectal cancer
El virus de la hepatitis C (VHC) es un hepacivirus con envoltura, cuyo genoma es una molecular de ARN de cadena sencilla y polaridad positiva de unas 9.6 kb. Aproximadamente el 3% de la población mundial está infectada por el VHC. Aunque la terapia con interferón y ribavirina ha logrado que 40% de los pacientes infectados con el VHC-1b resuelvan la infección, la búsqueda de nuevas alternativas terapéuticas es un objetivo prioritario en la práctica clínica. Estudios en otros modelos víricos han mostrado que el 5-fluorouracilo (5FU) es capaz de disminuir la infectividad in vitro y conducir a la población vírica a la llamada catástrofe de error y, consecuentemente, a su vírica a la llamada catástrofe de error y, consecuentemente, a su extinción. Para evaluar el efecto in vivo del 5FU sobre el VHC, se estructuraron 250 pacientes atendidos en el hospital clinic por presentar cáncer colorectal, tres de estos pacientes estaban infectados por el VHC. Se recolectaron sueros de los 3 pacientes 1 mes y justo antes de comenzar la terapia con 5FU como coadjuvante para el tratamiento del cáncer colorectal, así como el quinto día de la primera semana de tratamiento y el último día del mismo (4º mes). La estructura de las quasiespecies (QS) de los 3 aislados del VHC se estudió analizando 3 regiones del genoma vírico: 5' no codificante (5'NC), la región de la evuelta E2, incluyendo la región hipervariable (HVR-1), y la región no estructural NS5A, inclyendo el dominio de unión a PKR (PKR-bd). Todas las regiones fueron amplificadas mediante RT-PCR con cebadores específicos y utilizando enzimas con capacidad correctora de errores. Tras la clonación, se secuenciaron una media de 26 clones/muestra.
Tras alinear las secuencias, se calculó la complejidad, la diversidad y el tipo de cambios de nucleótido, así como las distancias genéticas, Ks, Ka y frecuencias de mutación de cada QS. Nuestros datos indican que, en las condiciones
