La tesis doctoral estudia la epistemología de la biología de Ayala. Y se divide en tres partes. La primera incluye los dos primeros capítulos y trata de la teoría de la ciencia para enmarcar la biología de Ayala como una biología evolutiva e irreductible a la física. La segunda parte, que es la central, incluye tres capítulos en los que se examinan las tres características básicas de la biología de Ayala: autonomía, teleología y evolución. La tercera parte dedica dos capítulos a estudiar la idea de progreso y las dimensiones éticas y hasta religiosas de la biología evolutiva de Ayala.
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