Structural studies of membrane proteins: the coupling protein trwb of plasmid r388 and the pore-forming toxin frac

• Autores: Ariel Mechaly
• Directores de la Tesis: Marcelo Eduardo Guerin (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad del País Vasco - Euskal Herriko Unibertsitatea ( España ) en 2009
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Félix María Goñi Urcelay (presid.), Helena Ostolaza Etxabe (secret.), Hugo Monaco (voc.), Armando Albert de la Cruz (voc.), Pedro M. Alzari (voc.)
• Materias:
  • Física
    • Física molecular
      • Estructura molecular
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• Resumen

  • Las proteínas de membrana participan en una amplia variedad de procesos celulares tales como la comunicación de célula a célula, el transporte de solutos y la conversión de energía. Esta diversidad funcional se refleja en el gran número de genes que codifican proteínas de membrana, por lo general, 20-30% de los proteomas de la mayoría de los organismos. Alrededor del 40% de las dianas terapéuticas son proteínas de membrana y por lo tanto conocer la estructura tridimensional de este tipo de macromoléculas ha despertado gran interés. Sin embargo, el número disponible de estructuras de proteínas de membrana a alta resolución es escaso. En este trabajo se realizó la caracterización estructural de dos proteínas membranas: la proteína acopladora TrwB del plásmido conjugativo R388 de E. coli y la toxina formadora de poro FraC de la anémona de mar Actinia fragacea. Utilizando dispersión de rayos-X a bajo ángulo (SAXS) se obtuvieron modelos a baja resolución de TrwB, estos modelos son consistentes con la estructura cristalográfica de TrwB¿N70 correspondiente a su región citosólica y compatible con un dominio transmembrana formado por un manojo de doce ¿-hélices. Por cristalografía de rayos-X se resolvió a 1.8 Å de resolución la estructura cuaternaria de la toxina formadora de poro FraC perteneciente a la familia de las Actinoporinas. La estructura nonamérica resuelta corresponde a un intermediario no-lítico del mecanismo de formación de poro por este tipo de toxinas.