Resumen de Spin glasses, protein design and dedicated computers
La tesis, dividida en tres partes, trata de la simulacion de modelos de vidrios de espin, de un algoritmo novedoso para el diseno de proteinas, y del desarrollo del superordenador Janus.
En la primera parte se introduce el tema de los vidrios de espin, tanto en su historia y en el interes experimental de este tema, como en los modelos teoricos desarrollados y en las herramientas de Mecanica Estadistica y de simulacion numerica que se suelen usar para el estudio de este argumento. Se presentan los resultados obtenidos simulando algunos modelos en concreto, como el modelo de Potts Glass estandar, y con permutaciones, el modelo AFM RP2, y un estudio de la dinamica del modelo de Edwards-Anderson para tiempos comparables a los tiempos experimentales.
La segunda parte de la tesis se centra en las proteinas, tratando de introducir un algoritmo nuevo para el diseno de una estructura tridimensional deseada. Empleando una funcion energia ya utilizada con cierto exito en la literatura para disenar secuencias, proponemos un metodo de diseno que trate de considerar tambien la entropia conformacional de los rotameros de cada secuencia, termino que no se suele tener en cuenta en los algoritmos usuales.
En la tercera parte finalmente se presenta el super ordenador Janus, desarrollado en la Universidad de Zaragoza, en colaboracion con otros Centros Espanoles e Italianos, para la simulacion de vidrios de espin y la resolucion de problemas relacionados con los modelos de proteinas.
